Annotathon אימון ביואינפורמטיקה באמצעות ביאור רצף metagenomic.
הורד עכשיו

Annotathon דירוג וסיכום

Annotathon תגים

קוּרס הַדְרָכָה ביואינפורמטיקה ביואינפורמטיקה כמובן אימון ביואינפורמטיקה.

Annotathon תיאור

אימון ביואינפורמטיקה באמצעות ביאור רצף metagenomic. Annotathon היא סביבת הוראה באינטרנט עבור סטודנטים לאוניברסיטה כדי לעקוב אחר קורס bioinformatics בסיסי. שרת מקוון מיישם את Annotathon זמין בכתובת: http://annotathon.univ-mrs.fr/We יש לנו את הסכום הגובר של נתונים metagenomic זמין לציבור כדי לפתח סביבת ההוראה שבה סטודנטים לתואר ראשון מקבלים את ההזדמנות " הפעל נתונים לידע "# :. בשם Annotathon, פלטפורמת הוראת האינטרנט הזו מטפחת עבודה צוות ומנחה המנטרים החניכים דרך כל שלב של ניתוחי סיליקו, מזיהוי ORF לסיווג פונקציונלי ופרופיל. יצירת תוצאות גלם היא חלק בלתי נפרד מהתרגיל, אך דגש כבד הוא לשים על הפרשנות שלהם הערכה קריטית. פורמט מקוון מתאים באופן אידיאלי עבור מעורבות סטודנט מחוץ לכיתה, תוך ומאפשר למדריכים לספק annotators עם משוב רציף. מחזור הערכה איטרטיבי מאפשר לתלמידים להגיב לביקורת קונסטרוקטיבית ולייצר גרסאות משופרות של ההערות שלהם. סקר יציאת סטודנט מראה כי למרות מאתגר, המחקר של כתבי רצפים לא מסומנים הוא תמריץ מרכזי ל -75% מהמשתתפים. ההצלחה של גישה זו מסתמכת על הדברים הבאים: i) למידה על ידי עושה: Bioinformatics הוא הטוב ביותר הציג על ידי ניסיון ראשון; השיקולים התיאורטיים קלים יותר לתפוס פעם את כל ה- Tools.II) למידה על ידי חזרה: ניתוח ברציפות כמה רצפים נותן לתלמידים הזדמנות לחוות מגוון רחב של מצבים, למשל. "אזור הדמדומים" דמיון, או "אשפה, אשפה החוצה" עץ phylogenetic reconstuctions.III) למידה מתוך ביקורת בונה: מתן סטודנטים הזדמנות לתקן את עצמם התקדמות בולטת במהלך time.502 התלמידים השתתפו ב annotathon מעל העבר שלוש שנים, ניתוח סך של 2.3 MB של דנ"א מיקרוביאלי האוקיינוס, המייצג 9500 שעות של ביאור מצטבר. מעניין, סטודנט בעבודת יד בוערים הם בהסכם קרוב מאוד עם אלה שהושגו על ידי צינורות ביאור אוטומטיים. בהתבסס על תצפיות אלה, אנו קוראים לעמיתינו לשקול הצטרפות ליוזמה ליצור "רשת של annotators לתואר ראשון ברחבי העולם". בהיסוס, כצוותים נוספים מצטרפים, זה יכול להוביל לקהילת ביאור חינוכית עם חדר לתרומה מדעית. קוד פתוח מקוון Annotathon סביבה (http://annotathon.univ-mrs.fr) מוצע כבסיס ליוזמה משותפת זו. דרישות: · PHP · MySQL

Annotathon תוכנה קשורה