 | Indelextrattor.indelextrator הוא יישום שמייצר מסכות יישור שונים בנוסף למסכה של אינדל. |
| הורד עכשיו | |
Indelextrattor. דירוג וסיכום
פרסומת
Indelextrattor. תגים
Indelextrattor. תיאור
Indelextrator הוא בקשה שמייצרת מסכות יישור שונים בנוסף למסכה של אינדל. יישור רצף מולקולרי הוא הבסיס של ניתוח פילוגנטי מולקולרי, אך הוא לעתים קרובות אחד ההיבטים הנפוצים ביותר נחשב. יישור מכילים לעיתים קרובות עמדות שקשה ליישר (כלומר באזורים אינדלין) אשר עשויים להיות "בעריכת עין" או להסירו לפני ניתוח. מסכה של אינדל עבור זיהוי קל והסרה של אינדיס ואת היישור שלהם מעורפל. מסכות היישור משמשים לשמירת עמדות "רעולי פנים" של יישור לתבניות קבצים רבות ושונות שונות. . כתוצאה של טיפול בתבנית הקובץ החזקים של Indelextrator; אתה יכול להשתמש בו פשוט עבור רצף ויישור פורמט קובץ ההמרה! הנה כמה תכונות עיקריות של "Indelextractor": · קלט / פלט פורמטים · indelextractor מנצל את העוצמה של bioperl לטיפול ברצף רבים קלט / פלט פורמטים עבור רצף כללי טיפול ומניפולציה. לכן, רצף רבים פורמטים של קבצים יישור נתמכים, והם מוכרים על ידי הרחבות קבצים. הקבצים חייבים להיות תוסף קובץ תואם כדי indelextractor יכול לקבוע במדויק את פורמט הקובץ הנכון. · מסכות יישור · indelextrator שפותחה בתחילה כדי לסייע אוטומציה של המשימה של הזיהוי והסרה של אינדל. לשם כך, מסכת האינדל פותחה, לפיה כל עמדת היישור הוכח על ידי תו ברצף בסגנון קונצנזוס כדי לזהות עמדות שנוצרו חלק מאינדל (אזורים רעולי פנים) ואלו שלא (אזורים לא מסונקים). עם זאת, מסכות נוספות זמינים כעת: מסכות משתנה, משתנה וקונצנזוס. לאחר שנוצר מסכה, ניתן להשתמש בו כדי לחסוך תת-יישור (עמדות מסיכות / חסרות מסכות), או כמידע נוסף בפורמטים של יישור עשיר יותר (למשל נקסוס) בעת שמירת היישור כולו לקובץ. · תכונות עזר · ערכת התכונה של Indelextrater הורחבה כדי לאפשר יישור של רצפים באמצעות clustalw להתבצע מתוך Indelextractor ואת היכולת לפוצץ רצפים נגד מסדי נתונים NCBI; אפשרויות הן זמינות באמצעות ההעדפות של Indelextrator.
Indelextrattor. תוכנה קשורה
