jmodeltest מודל phylogenetic ממוצעים
הורד עכשיו

jmodeltest דירוג וסיכום

jmodeltest תגים

syntatics phylogenetic. החלפה נוקליאוטיד ניתוח פילוגנטי מנתח פילוגנטי טביעת רגל פילוגנטית הקשר פילוגנטי פילוגנטי בדוק בדיקה phylogenetic. בודק בדיקה phylogenetic. בדיקה phylogenetic בדיקה לחשב רשת פילוגנטית תחליף נוקליאוטיד מודל phylogenetic ממוצע מודל פילוגנטי לאחסן רשת פילוגנטית ניתוח נתונים פילוגנטי נתונים phylogenetic. חסינות במשימה פילוגנטית ניתוחים phylogenetic. לבנות supertrees phylogenetic. ליצור supertrees phylogenetic. בדיקת עצמאות phylogenetic. ניתוח פילוגנטי טיפוסי. היפותזה פילוגנטית קשר פילוגנטי שחזור phylogenetic. טופולוגיה phylogenetic. גנרטור phylogenetic. שיא ממוצע

jmodeltest תיאור

JModeltest הוא בקשה מדעית שיכולה לבצע מבחר של תחליפי נוקליאוטידים, שימושי בניתוח DNA, עם תמיכה בחביות גדולות של נתונים. זהו קוד פתוח, פרויקט חוצה פלטפורמות שמטרת לתלמידים, למורים, כמו גם חוקרים בשדה DNA. רוב הניתוח נעשה באופן אוטומטי, עם זאת, ידע נוקליאוטיד מתקדם צפוי מהמשתמש, בעיקר לפרשנות של התוצאות. JModeltest מסתמך על סביבת Runtime Java לרוץ בהצלחה, אבל זה התלות היחידה שאתה צריך לספק. זה מגיע עטוף בתוך חבילה ניידת, ולכן ההתקנה אינה נדרשת. הממשק של JModeltest הוא פשוט למדי, אבל את הפונקציות מוטבע בתוכו הם בעלי אופי מורכב יותר. רוב GUI מוקדש לניתוח הנתונים ואת הדיווחים הנובעים מתהליך זה, אשר בהתאם למידע הכלול בתוך קובץ המקור, יכול להיות ארוך למדי. ישנן חמש אסטרטגיות שונות של בחירה, ואלה מוטמעות בתוך תפריט ניתוח, כדלקמן: AIC (ACAIKE מידע קריטריון), BIC (קריטריון מידע Bayesian), DT (תורת ההחלטות), HLRT (מבחני יחס ההיררכי של ההיררכיות) וממוצע פילוגני. כל אלה יכולים להיות מוגדרים לפני תהליך הניתוח בפועל; לדוגמה, אתה יכול להתאים את מרווח הסמך או להגדיר את היישום לבצע מודל ממוצעים. כדי לעלות אותו, אתה יכול גם להורות לתוכנית לעשות חישוב ניקוד סבירות כי תלוי וריאציה שיעור להתאמה אישית מודל עץ נבחר מראש. לסיכום, JModeltest יכול להציל את הזמן ואת המאמץ מדענים ישקיע בביצוע פעולות ניתוח DNA על ידי אמצעים מסורתיים. עם זאת, מומלץ כי התוצאות להיות מאומתות לחלוטין, רק במקרה. נבדקו על ידי אנדריאה Matei, עודכן לאחרונה ב -17 באוגוסט 2014

jmodeltest תוכנה קשורה