Hon-New שיטה לחישוב מרחקים שמרניים ורדיקלים
הורד עכשיו

Hon-New דירוג וסיכום

Hon-New תגים

סדר פעולות רצף DNA דננה התמוטטות קיצונית אפקט רדיקלי קיצוני מרחקים חומצת אמינו מרחקים Tracker. שיעור nonsynonynymous למצוא מרחקים קדומים של הכנסייה מרחק לא נרדף סיווג חומצות אמינו מרחק nonsynonymous רדיקלי תחליף nonsynonymous לומד רדיקלי להמיר מרחקים מיפוי מרחקים

Hon-New תיאור

היישום HOM-New היה מיועד לאמידת מרחקים שמרניים ורדיקלים בין רצפי דנ"א קידוד חלבון. השיטה משתנה מהשיטה המקורית של יוז, OTA ו- NEI (1990) על ידי לקיחה בחשבון את הטיה המעבר. שלושה סוגים של סיווג חומצות אמינו (תשלום, קוטביות וזה של מייטה ו Yasunaga) מסופקים. אפשר גם להגדיר חומצת אמינו שמרנית ורדיקלית על ידי עצמך. אפשר להגדיר קבוצות חומצות אמינו, כך ששינויים בין הקבוצות הם קיצוניים ובתוך קבוצות שמרניות. כדי לעשות זאת, יצירת קובץ בשם self.div. בקובץ זה, הקו הראשון צריך להיות קבוצות של חומצות אמינו (למשל, במקרה של תשלום, יש שלוש קבוצות ), השורה השנייה היא מספר חומצות האמינו בקבוצה הראשונה, חלל, וחומצות האמינו בקבוצה. קוד אחד של חומצות אמינו צריך לשמש. השורה הבאה תהיה המידע עבור הקבוצה השנייה. אחד רק צריך להזין את המידע של קבוצות N-1 הראשון, אם יש n קבוצות בסך הכל, כי הקבוצה האחרונה יכולה להיות נגזרת מהמידע של קבוצות N-1 הראשון.

Hon-New תוכנה קשורה