Treefit

ניתוח נתונים גנטי קל.
הורד עכשיו

Treefit דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • Freeware
  • שם המפרסם:
  • Steven Kalinowski
  • מערכות הפעלה:
  • Windows All
  • גודל הקובץ:
  • 82 KB

Treefit תגים


Treefit תיאור

עצים אבולוציוניים משמשים לעתים קרובות לתיאור יחסים גנטיים בין אוכלוסיות. עצים ההיררכיים, התפוצצות הם מודל סביר לאבולוציה של רצפי דנ"א ומינים, אך ייתכן או לא יכול להיות המתאים לתיאור סטרוקטרו האוכלוסייה באוכלוסיות המחוברות על ידי זרימת הגן. לדוגמה, אם אוכלוסיות מסודרות בדפוס אבן דריכה, היחסים הגנטיים בין אוכלוסיות לא יעברו דפוס היררכי, והצטרפות השכנות המסורתיות או עצי Upgma לא יהיו כלים מתאימים לתיאור המבנה של אוכלוסיות כאלה. Treefit הוא יישום פשוט שפותחה כדי לעזור לך לנתח כמה טוב עץ מתאים את הנתונים הגנטיים העץ חושב. Treefit יוצר עצי השכן ואת עצי Upgma ממטריקס המרחק הגנטי, ולאחר מכן משווה את המרחק הגנטי שנצפה בין אוכלוסיות עם המרחק הגנטי בעץ. הדמיון בין מרחקים אלה הוא להביע כמו R- בריבוע, הסטטיסטיקה המוכרת המשמשת לסיכום את התפזורת של נקודות סביב קו רגרסיה לפחות ריבועים.


Treefit תוכנה קשורה