Samamate דירוג וסיכום
Samamate תגים
Samamate תיאור
Samamate הוא שימושי, קל לשימוש בכלי שתוכנן במיוחד עבור עיבוד מהיר קבצים סם כדי להפוך כמה נהלים סטנדרטיים יותר בניתוח נתונים RNA-Seq. באמצעות קבצי ביאור רגיל או מותאם אישית, Sammate מאפשר למשתמשים לחשב במדויק כיסוי קריאה קצר עבור כל מרווחים גנומיים. בפרט, עבור נתוני RNA-SEQ, SAMMATE מחשב במדויק ביטוי שפע ציונים עבור כל מרווחים גנומיים מותאמים אישית באמצעות קורא קצר שמקורם הן אקסון אקסון אקסון צמתים. Sammate גם מהר מחשבת מפת אות גנום שלם ב רזולוציה בסיסית, המהווה את הקלט הנדרש לפתרון מערך של בעיות ביואינפורמטיקה. SAMMATE יצוא קובץ מתנועע עבור ויזואליזציה יישור בדפדפן הגנום UCSC, ואת דוח נתונים סטטיסטיים יישור. Sammate תואם הן קצה יחיד ו tride-end technologies. תכונות עיקריות: חישוב ציון גנומי תכונה באמצעות נתוני RNA-SEQ יצירת אותות אות עבור איתור שיא יצירת קבצי להתנועע להדמיה יצירת יישור דוח התאמה אישית של קובץ ביאור ג 'ין התאמה אישית של שם כרומוזום בקובץ הפלט
Samamate תוכנה קשורה