VorOprot כלי לניתוח של תכונות גיאומטריות של מבנה חלבון
הורד עכשיו

VorOprot דירוג וסיכום

VorOprot תגים

מִבְנֶה גֵאוֹמֶטרִיָה גֵאוֹמֶטרִי חֶלְבּוֹן סינתיסייזר גיאומטרי אנליסטית גיאומטרי באנליזה גיאומטרית כלי דוגמנות גיאומטרי מסך גיאומטרי הצג מבנה חלבון הצג מבנה חלבון ניתוח חלבון ניתוח מבנה ספריית רבומטרי multigrid. מבנה חלבון תכונות חלבון גיאומטרי. חלבון נתונים ניתוח בנק חלבון קידוד ניתוח גנים חקור מבנה חלבון ניתוח רצפים חלבונים ניתוח משפחות חלבון ניתוח מבנה המוח ניתוח מבנה תקופתי ניתוח מבנה נתונים. מבנה 3D חלבון

VorOprot תיאור

היכולת לנתח ולדמיין תכונות גיאומטריות של מבנה תלת מימדי (3D) חלבון הוא יסודי למחקרים של קיפול חלבון, אריזת שאריות, עגינה, אינטראקציות חלבון חלבון, וכו 'כמה מבני נתונים גיאומטריים מתקדמים מאפשרים לבצע כזה ניתוח באופן מקיף. עם מטרה זו בראש, פיתחנו Voroprot, כלי אינטראקטיבי לניתוח של תכונות גיאומטריות של מבנה חלבון. בפרט, החלטנו לספק חלק מהשיטות הגיאומטריות, שלא נכללו בחבילות תוכנה דומות אחרות. Voroprot מבנה ומציג Apollonius תרשים (הידוע גם בשם Voronoi דיאגרמה של תחומים) ו Apollonius גרף (הידוע גם בשם delaunay triangulation של תחומים) של אטומי חלבון, בהתחשב בכל אטום להיות כדור 3D של רדיוס Van der Walals. Voroprot נובע אטומי חלבון משטחים ומשטחים נגישים ממס ממספר דיאגרמה אפולוניוס ומאפשר להדמיה שלהם. בנוסף, זה יכול למצוא להציג חללים בתוך מבנה חלבון. כדי לבנות תרשים אפולוניוס ב Voroprot, השתמשנו ביישום האלגוריתם שלנו, אשר ניתן ליישם לא רק עבור אטומי חלבון, אלא גם עבור כל קבוצה של נקודות או כדורים 3D. תן Voroprot לנסות להעריך באופן מלא את היכולות שלה!

VorOprot תוכנה קשורה