 | Oligocheckבדוק את איכות בדיקות phylogenetic ו primer קובע |
| הורד עכשיו | |
Oligocheck דירוג וסיכום
פרסומת
Oligocheck תגים
Oligocheck תיאור
Oligocheck הוא כלי מבוסס Java שנועד על מנת להעריך חוסן, על ידי הערכת קבוצת פריימר או טווח phylogenetic של בדיקה כמספר אי התאמה עם רצף היעד הפוטנציאלי גדל. המשתמש מספק פריימר להגדיר או בדיקה לבדוק, יחד עם מסד נתונים של רצפים חומצה גרעין. Oligocheck בודק את פריימר להגדיר או בדיקה נגד כל רשומה רלוונטית במסד הנתונים והערות אם התאמות מתרחשות עם מספר הולך וגדל של אי התאמות בסיס מותר. הניתוח המתקבל מוצג בצורה גרפית לצד הנתונים ברצף. היכולת של חומצה גרעין פריימר קובע ובדיקות כדי לקשור באופן בלעדי רצף חומצה גרעין הנכון הוא בסיסי למיקוד מדויק של קבוצות פילוגנטיות ספציפיות. ספציפיות כאלה תלויה במידה רבה על ייחודו של האזור של רצף חומצה גרעין אלה oligonucleotides יעד. ככל שהאזור הייחודי יותר, כך יהיה חזק יותר את הפריימר או בדיקה להיות חישול רק למטרה המיועדת, גם אם וריאציות ביחס לטמפרטורה ופרמטרים רלוונטיים מבחינה ביוכימיים אחרים גורמים לאוליגונוקלוטידים מחייבים בהצלחה עם הפרשי בסיס אחד או יותר. לפיכך, ניתן לראות פריימר חזק או בדיקה כאדם שאינבל באופן בלעדי למטרה המיועדת שלו גם כאשר אחד או יותר חוסר התאמה מותר.
Oligocheck תוכנה קשורה
