 | גדי-אדמקסזיהוי שגיאות גנוטיפ וגידול לאוכלוסיות |
| הורד עכשיו | |
גדי-אדמקס דירוג וסיכום
פרסומת
גדי-אדמקס תגים
גדי-אדמקס תיאור
Gedi-Admx הוא יישום שנבנה כדי להתמודד עם נתוני גנוטיפ של אנשים שאינם קשורים. מסקנות שושלת מקומית משתמשת HMMS HMMs מאומנים על haplotypes אבות כדי לקבל גנוטיפים בכלל הודעות SNP מוקלדים תחת כל מוצא מקומי אפשרי. Gedi-Admx מקצה לכל locus את המוצא המקומי כי מניב את הדיוק הזקיפה הגבוהה ביותר, כפי שהוערך באמצעות ערכת הצבעה משוקלל על בסיס חלונות SNP מרובים מרוכזים על מוקד עניין. שגיאת שגיאות וזקיפה של גנוטיפים חסרים ב SNPs מודפס מבוצעת באמצעות Multilocus Genotype הסתברויות מחושבות על בסיס HMM המפקד המקביל למוצא המקומי להסיק. זקיפה של גנוטיפים בכל SNP לא מסודר מתבצעת על בסיס ההסתברויות גנוטיפ האחורי מחושבת באמצעות Factorial דומה HMM פורש K (ברירת המחדל k = 10) מודפס SNPs לפני ואחרי Locus נזקף. חבילת Gedi-Admx מספקת שיטות עבור: · מסיקת שושלת מקומית · זיהוי שגיאות גנוטיפ של SNP ותיקון · זקיפה של גנוטיפים חסרים ב SNPs מודפסים, ו · זקיפה של גנוטיפים ב- SNPS לא אושר.
גדי-אדמקס תוכנה קשורה
