 | Haploview.ניתוח haplotype קל. |
| הורד עכשיו | |
Haploview. דירוג וסיכום
פרסומת
- רישיון:
- Freeware
- שם המפרסם:
- Daly Lab
- מערכות הפעלה:
- Windows
- גודל הקובץ:
- 6 MB
- תאריך הוצאה:
- 2021-04-28 09:22:55
Haploview. תגים
Haploview. תיאור
ניתוח הפלוטיפ מיועד לבדיקה גנטית מולקולרית על מנת לזהות קטעי DNA המשתפים דמיון. Haploview נוצר כדי לשפר את המשימות הנוגעות לניתוח כזה. היישום הוא מבוסס Java, מה שהופך אותו לחצות פלטפורמה ואין צורך לעבור תהליך ההתקנה. פורמטים של קבצים ו optionslooks הם פשוטים עד לנקודה, עם פאנל יחיד שמקבל את הטעינה של עד חמישה קובץ פורמטים: תקן הצמדה, dumps נתונים מפרויקט Hapmap, שלב או פלינק. יש גם תמיכה טעינת קבצים מרובים על ידי החלת שורת הפקודה "-Batch". ללא קשר לפורמט הקובץ הנבחר שטעון ביישום אותם פרמטרים ניתן להתאים אישית. אלה מתייחסים להשוואה זוגית של סמנים, אשר יכול להיות מעל ערך המשתמש שצוין (ברירת המחדל מוגדר 500KB). פרמטר שני מתייחס לכמות הגנוטיפים חסרים ביחידים. בהתאם לערך להגדיר משתמש, אנשים אלה יכולים להיות נשלל מן הניתוח. הגדרות תצורה נוספות זמינות עבור חלק מהפורמטים של הקבצים הנתמכים. במקרה של משתמשי הצמדה סטנדרטיים יש את האפשרות לאפשר בדיקות האגודה, נתונים שלישיית משפחה או לטעון קובץ בדיקה. לאחר טעינת קובץ כזה קיימות תצוגות שונות, הכוללות מגרש LD, Haplotypes, צ'קים סמנים או טאגר (משלבת שיטות זוגיות עם היעילות הפוטנציאלית של גישות multimarker). עם פורמט שלב ניתן להוריד את מסלול המידע של HAPMAP אם יש חיבור לאינטרנט. הפונקציונליות של התוכנית יכולה לשמש להפעלת ניתוח LD ו Hapletype, כמו גם להעריך את תדר הפלוטיפ באוכלוסייה. רשימת הפונקציות תומכת גם בבדיקת תמורה שיכולה לחשוף משמעות האגודה. סיכום הוא תוכנית עם יישומים מדעיים התומכת במספר משימות הקשורות לתהליך של ניתוח הפלוטיפ. זה יכול לשמש התלמידים המוכרים עם הנושא והוא גם גמיש במונחים של פונקציונליות ושימושיות. נבדקו על ידי Ionut Ilascu, עודכן לאחרונה ב -7 במרץ, 2014
Haploview. תוכנה קשורה
