AMMP מכניקה מולקולרית המודרנית המודרנית
הורד עכשיו

AMMP דירוג וסיכום

AMMP תגים

לְתַפְעֵל מולדולה למד מכניקה מֵכָנִיקָה מכניקה משחקים מעבדות מכניקה סימולטור מכניקה נוקלי ניתוח מכניקה ניוטונית ללמוד מכניקה ניוטונית מכניקה ניוטונית ללמוד מכניקה קלאסית לתפעל את המולקולה לתפעל מקרומולקולה חומצות גרעין מכניקה מכונה ניתוח מכניקה ניוטונית חלונות 2007 יישום צ 'אט פייסבוק וידאו מלא וידאו הסכם הלוואה פשוטה יישום משחקים תבנית הודעה בטלפון טפט ימאהה תופים התקן יצירתי Infra52x. Zuma Deluxe הפעלה באדי בדוק כלי רשת Ware. חיר

AMMP תיאור

יישום AMMP פותחה כדי להיות מודרני במכוניקה מולקולרית מובלטת, דינמיקה ודוגמנות. זה יכול לתמרן הן מולקולות קטנות macromolecules כולל חלבונים, חומצות גרעין פולימרים אחרים. בנוסף לתכונות סטנדרטיות, כמו דינמיקה מולקולרית יציבה מספרית, שיטת כפולה מהירה לכלול כל האטומים בחישוב של פוטנציאלים לטווח ארוך ואופטימיזרים מבניים חזקים, יש לו בחירה גמישה של פוטנציאלים ויכולת פשוטה אך רבת עוצמה לתמרן מולקולות ולנתח את הפרט תנאי אנרגיה. יתרון גדול אחד על פני תוכניות רבות אחרות היא כי קל להציג קישורים פולימריים לא סטנדרטיים, ליגנות חריגות או שאריות לא סטנדרטיות. הוספת אטומי מימן חסרים והשלמת מבנים חלקיים, שקשה לתוכניות רבות, הן פשוטות ב- AMMP. AMMP רק מבין את השפה שלו. אתה קורא קובץ קואורדינטות קיים על ידי עריכת אותו לתוך שפת ה- AMMP. התוכנית preammp (prewin) עושה את זה. Premmp יכול להיות מופעל על עצמו, או נקרא מתפריט קובץ ב- AMMP95. Premmp דורש כמה תשומות. תתבקש שתתבקש לכל אחד מהם בתפריט 'בחירת קבצים של Windows'. אם אתה לא אוהב את זה פשוט לבטל את החלון ולהיכנס שם הקובץ בחלון האיש prewin (זה פשוט יותר לעשות מאשר לתאר!). כאשר אין לך קובץ, כגון בעת יצירת קואורדינטות מאפס תצטרך לבטל את התפריט 'בחירת הקבצים של Windows' ולאחר מכן הזן לחזור לחלון הראשי. Premmp עובד רק שאריות אחת בכל פעם. יהיה עליך לספק את ההצמדה Innmonnamer בפולימר. סקריפטים כגון peplink.Amp (עבור חלבונים) ו ndick.Amp (עבור הקישור DNA / RNA סטנדרטי) מסופקים. אלה נוצרו על ידי יצירת התבנית עבור dimer ומוציאים את התנאים המתאימים. הם גם מקום טוב לראות כיצד לתמרן אטומים ופוטנציאל בתסריט אוטומטי. כדי ליצור מולקולה חדשה אתה צריך קודם להגדיר תבנית. לאחר מכן אתה מפעיל preammp. כאשר Preammp מבקש Set Set Dont להזין כל שם קובץ. שלא כמו במקרה הקיים המולקולה, Premmp לא יוכלו להסתכל באופן אוטומטי את סוג של מולקולה מן הקואורדינטות. לכן תתבקש להזין שם מולקולה. זה מוגבל לשלושה תווים כדי להתאים לפורמט PDB. (מצטער על זה, אבל זה איך זה).

AMMP תוכנה קשורה