Dnadistree

תוכנה עבור מסקנות phylogeny מבוסס מרחק מ DNA רצפים.
הורד עכשיו

Dnadistree דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • Freeware
  • שם המפרסם:
  • Christian Michel
  • מערכות הפעלה:
  • Windows All
  • גודל הקובץ:
  • 393 KB

Dnadistree תגים


Dnadistree תיאור

Dnadistree נועד להסיק עצים פרילוגנטיים מבוססי מרחק המציגים קשרים טופולוגיים מדויקים בין מינים. מדויק יותר, Dnadistree מבצע כמה צעדים רצופים: 1. הוא קורא רצף DNA יישור (נוקליאוטידים או קודונים); 2. הוא מעריך מרחקים מזויפים לא משוחדים בין כל זוג רצפים. עבור מטרה זו, Dnadistree משתמשת נוסחאות רבות לעתים קרובות מבוסס על מודלים אבולוציוניים של דנ"א או מודלים codon (ראה כאן לפרטים נוספים); 3. הוא בונה עץ phylogenetic הודות לארבעה אלגוריתמים Agglomerative; 4. הוא מחשב אמצעים סטטיסטיים הקשורים למטריצות המרחק ו / או עצים מבוססי מרחק. עם זאת, Dnadistree לא נועד להעריך אורכים ענף חזקים; מומלץ להשתמש ב- Fitch (בחבילת Phylip), Fastme, Phyml או PAML עם העצים שהוסקו על ידי DNADISTEE כמו אומדני סניף מדויק יותר או ML מבוסס. תן dnadistree לנסות לראות מה זה באמת מסוגל!


Dnadistree תוכנה קשורה