חוקר חלבון

חקור מבנה חלבון מהיר וקל.
הורד עכשיו

חוקר חלבון דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • GPL
  • שם המפרסם:
  • Brian White umb
  • מערכות הפעלה:
  • Windows All
  • גודל הקובץ:
  • 206 KB

חוקר חלבון תגים


חוקר חלבון תיאור

תרגילי מעבדה רבים משתמשים בתוכנת ויזואליזציה מולקולרית המאפשרת לתלמידים "לראות" חלבון בצורתו המלאה בתלת-מימדי ולעשות השערות על האינטראקציות בין שרשראות צד שונות. עם זאת, תוכניות אלה אינן מאפשרות לתלמידים לבדוק את ההשערות שלהם, משום שתוכנת ההדמיה המולקולרית אינה מאפשרת לתלמידים לבצע שינויים ברצף החלבון ולצפות בהשפעותיהם על מבנה החלבון ותפקודם. חוקר חלבון הוא כלי שימושי מאוד שנועד לתת למשתמשים הזדמנות לחקור אינטראקטיבית מבנה חלבון ותפקוד במערכת פשוטה. זוהי מודל פשוט מאוד של קיפול חלבון. זה לא נועד לחזות את המבנים הנכונים של כל חלבונים; הוא נועד להמחיש את העקרונות העיקריים המעורבים בתהליך זה. תכונות עיקריות: חומצות אמינו יש שרשראות צדדיות של הידרופוביזציה משתנה, תשלום, ואת יכולת מליטה מימן. חומצות האמינו מתחבר בין שרשרת לא מסועפת שיכולה להתכופף. חומצות אמינו הידרופובי נוטים למנוע את המים המקיפים את החלבון; חומצות אמינו הידרופיליות תקשרו למים. חומצות אמינו שיכולות ליצור אג"ח מימן נוטה ליצור קשרים מימן אם הם יכולים. חומצות אמינו טעונה חיובית נוטה ליצור קשרים יוניים עם חומצות אמינו טעונה שלילית אם הם יכולים. כמו חומצות אמינו טעונה יהיה להדוף אחד את השני אם הם יכולים. אינטראקציות יונית הם חזקים יותר מאשר קשרים מימן, אשר חזקים יותר מאשר אינטראקציות הידרופובי. חלבונים יכולים להיות מקופלים תחת חמצון (איגרות החוב דיסולפיד און) או צמצום (איגרות החוב של דיסולפיד כבוי).


חוקר חלבון תוכנה קשורה