 | צפיפותכלי כדי לעזור לך עם המחקר שלך |
| הורד עכשיו | |
צפיפות דירוג וסיכום
פרסומת
צפיפות תגים
צפיפות תיאור
מיקרוסקופ אלקטרונים הפך כלי חשוב בביולוגיה מבנית. חלבונים רבים שאינם יכולים להתבצע כדי להתגבש בתוך 3D קריסטל מתאים קריסטלוגרפיה רנטגן יכול בכל זאת ללמוד על ידי מיקרוסקופ אלקטרונים, או כמו מולקולות יחיד או בצורה של גבישים 2D. עם זאת, מבנים וכתוצאה מכך יש רזולוציה נמוכה בהרבה. עם חריגים נדירים, מפות צפיפות אלקטרונים שהושגו על ידי מיקרוסקופ אלקטרונים אינם מספיקים כדי לזהות את המבנה ברזולוציה אטומית. במצבים מסוימים, מבנה ברמה אטומית של אותו חלבון בקונפורמציה אחרת זמין. צפיפות היא כלי שנועד לשלב מידע זה עם מבנה ברזולוציה נמוכה. זה כלי מבוסס python עושה את זה על ידי מעוות את המבנה האטומי הידוע כדי להפוך אותו להתאים את מפת צפיפות אלקטרונים נמוכה. הגמישות של החלבון מתואר על ידי מודל רשת אלסטי, אשר מצבים נורמליים נמוכים יותר מגדירים את הדפורמציות המותרות. הליך זה מבטיח כי שלמות החלבון נשמר במהלך העיוות. בהשוואה לאלגוריתמים דומים אחרים שפורסמו, מיושם ב"צפוטפית "יש את היתרון של נבדק על נתונים ניסיוניים אמיתיים עבור חלבון בגודל בינוני, CA-ATPASE. האלגוריתם ויישומו ל- CA-ATPASE תוארו ב
צפיפות תוכנה קשורה
