מודלים כלי לבחירת המודל המתאים ביותר של תחליף נוקליאוטיד
הורד עכשיו

מודלים דירוג וסיכום

מודלים תגים

החלפת כתובת אתר בְּחִירָה החלפת טקסט החלפה Nucleotide פרופורציה החלפת TRichView חילוף Cipher SHIFT-SUBLEATINE CIPHERS רצף נוקליאוטיד מנהל רצף נוקליאוטיד נוקליאוטיד תחליף חלקי תחליף כונן תחליף מונואלבי דגם החלפת נוקליאוטידים מוטיב נוקליאוטיד מודל תחליפי מורכב תחליף נוקליאוטיד מסגרת בחירת מודל הסבירות היררכית ביאור נוקליאוטיד דגם החלפת DNA. יישור נוקלאוטיד דגם החלפת DNA. נרדף חילוף תחליף nonsynonymous דגם החלפה פולימורפיזמים נוקליאוטידים מוטציה נוקליאוטיד חלק נוקלאוטיד

מודלים תיאור

ModelTest הוא פיסת תוכנה מתקדמת ואמינה שפותחה כדי לשרת מהנדסי גנטיקה בקביעת ההבדלים בין מודלים החלפת DNA באמצעות בדיקות ההשערה היררכית על מנת ליצור את התוצאות. ממשק שורת הפקודה היישום הוא מורכב למדי, כפי שהוא נועד למשתמשים מנוסים עם ידע רקע מוצק בגנטיקה, כמו גם מחשבים, במיוחד שכן הוא אינו מספק למשתמשים עם ממשק שורת הפקודה, אשר יכול לעשות את זה למדי מאתגר עבור טירונים. עם זאת, מודל אינו דורש התקנה, ולכן זה מספיק עבור משתמשים כדי פשוט לשחרר את קובץ ההפעלה על גבי מופע פתוח של שורת הפקודה ולחץ על מקש Enter, אשר בתורו יחולו את הפונקציות של התוכנית יחד עם הסבר קצר של הפקודות הזמינות. פונקציות ופועלים פרמטרים ModelTest נועד לעבוד עם קבצים שנוצרו על ידי PAUP * אשר מכילים את פרטי הגנטיקה הנדרשת, כמו גם קבצים המהווים ציוני יומן גולמיים יחד עם אומדני פרמטרים עבור המודלים שהוערכו. בצד הנגדי, השירות מייצר תיאור של בדיקות יחס ההסתברות שנערכו, ואת הערכים המקבילים שלהם, מידע אשר לאחר מכן לפרש והוקצה מודל נאות. המודלים הנתמכים מופיעים בממשק שורת הפקודה, כולל JC (JUKES ו- CANNOR), TRNEF (Tamura-nei עם תדרים בסיסיים בסיסיים), טים (מודל המעבר), GTR (זמן כללי הפיך), F81 (Felsenstein) ועוד כמה . במקביל, משתמשים יכולים לעבוד עם קבוצה מסוימת של פונקציות, שהודגם בחלון הראשי כדי להפוך אותם לקלים יותר להבנה ולהעסיק. כ- או להשתמש ב- BIC ולא AIC עבור כל הפעולות העתידיות (-B). מכשיר מקיף לקביעת מודל החלפה המתאימה לסיכום, מודל הוא יישום יעיל שפותח עבור אנשי מקצוע העובדים בתחום הגנטיקה, מציע להם את האמצעים להשוואת מודלים החלפת DNA, ובכך לסייע למשתמשים להחליט על מה הכי טוב שלהם מתאים את הנתונים שלהם.

מודלים תוכנה קשורה