חַיָה

ניתוח רצפים מולקולריים עם תוכנה זו.
הורד עכשיו

חַיָה דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • Freeware
  • שם המפרסם:
  • BEAST Team
  • מערכות הפעלה:
  • Windows All
  • גודל הקובץ:
  • 56.2 MB

חַיָה תגים


חַיָה תיאור

Bayesian ניתוח אבולוציוני הדגימה עצים או, פשוט לשים, חיה, הוא יישום המיועד לניתוח רצפים מולקולריים. תיאור מדעי יותר למטרה שלו יהיה כי הוא מספק את האמצעים לשחזר phylogenies וגם עובד כמו פלטפורמה לבדיקת ההשערה האבולוציונית ללא מיזוג על טופולוגיה עץ אחת. הוא מבוסס על Java, תלות שאינה הורדת באופן אוטומטי במהלך הליך ההתקנה של התוכנית. אם Java אינו נוכח במערכת המוצר אינו משגר. תפקידה ושליחה של החל, החיה דורשת הגדרות ראשונות, הכוללות מתן קובץ לדוגמה, הגדרת מספר השרשראות ובחירה בין דלתא או פרמטרים טמפרטורה. ניתוח של יכול לקחת די ארוך, במיוחד אם נעשה שימוש במחשב נמוך יותר. במהלך המבצע משאבי המערכת לא חסכו כפי שהם לשים תחת לחץ ניכר, הן כוח CPU ו RAM השימוש. בגלל פורמט XML שהתקבל על ידי היישום אין ניסיון לקבוע את סוג של חוקרי ניתוח רוצה לבצע אבל מציע את האפשרות לבחור אותו. לדברי תיעוד יש חסרון לגישה זו כמו בניית מודלים לא יכול לבצע היטב תחת שרשרת Markov Monte Carlo (MCMC) מסגרת מסקנת. גם על downside, הנתונים יש לבדוק בזהירות כי לאחר ניתוח זה חיה לא לבוא עם תשובה פשוטה. ככזה, במקרים מסוימים יש צורך בכמה tinkering כדי לוודא כי המידע עובדה כראוי. סיכום הוא תוכנן ככלי מדעי וזה לא מתייחס למשתמש הממוצע. עבודה עם זה לא קשה אבל לפרש את התוצאות ולוודא כי הנתונים כבר מעובד כראוי דורש רקע מוצק בניתוח רצף מולקולרי. נבדקו על ידי Ionut Ilascu, עודכן לאחרונה ב -22 במרץ, 2014


חַיָה תוכנה קשורה

Hon-New

שיטה לחישוב מרחקים שמרניים ורדיקלים ...

228 54 KB

הורד