Oslay

רצף התאמת קל.
הורד עכשיו

Oslay דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • Freeware
  • שם המפרסם:
  • Daniel C. Richter
  • מערכות הפעלה:
  • Windows All
  • גודל הקובץ:
  • 2.8 MB

Oslay תגים


Oslay תיאור

Oslay הוא חתיכת שימושי של תוכנה שנועדו להשתמש Synteny בין רצפים תואמים באסיפת יעד לבין מכלול התייחסות לפריסת הקשר (או פיגומים) באסיפת היעד. הכלי מספק להדמיה אינטראקטיבית של הפריסה המחושבת ואת התוצאה ניתן לייבא לתוך כלי עריכת הרכבה שריע לתמוך בעיצוב של זוגות פריימר עבור סגירת הפער. הערה: חינם למטרות אקדמיות. תכונות עיקריות: קורא שני קבצי Fasta (Contigs של היעד הרכבה רצף התייחסות / הרכבה) ואחד הפיצוץ / nucmer הקובץ הוא מסוגל למיין ולהזמין הן צירים בו זמנית אם רצפי יעד ונהיגים הם מכלולים לא גמורים הוא חל על גנומים procaryotic ו eukaryotic יש כמה אפשרויות לסנן ולהתאים נתונים כגון זמירה של קצות קונטיג ללא תחרות, סינון הפיצוץ להיטים, ... יצוא תצוגות התוצאה למספר פורמטים גרפיים (.jpg, .gif ,. צפיות, .png ו- .svg.) משנה או מייצר קובץ ACE חדש לייבא ישירות לתוך נידון עבור עיצוב פריימר פשוט מספק שימושי פונקציונליות זום מאפשר ניתוח חזותי של מכלולים ומטא-מכלולים למשל. מתרחשים של רקומבינציות או שגיאות בהתאמה.


Oslay תוכנה קשורה

מייגן

לנתח נתונים גדולים metagenomic עם הכלי הזה. ...

185 90.8 MB

הורד