NG-New. שיטה שונה nei-gojobori לחישוב מילה נרדפת ומרחקים nonsynonymous
הורד עכשיו

NG-New. דירוג וסיכום

NG-New. תגים

סדר פעולות רצף DNA דננה נוקליאוטיד שיעור nonsynonynymous למצוא מרחקים קדומים של הכנסייה מרחק נרדף מרחק לא נרדף מרחק nonsynonymous רדיקלי נרדף חילוף תחליף nonsynonymous שיטת Modified Rational נִרדָף

NG-New. תיאור

יישום NG-New פותחה כלי שורת פקודה קטנה להערכת מרחקים נרדפים ונסינוני בין רצפי דנ"א קידוד חלבון. השיטה משתנה מהשיטה המקורית Nei ו- Gojobori (1986) כדי לקחת בחשבון את הטיה המעבר. כדי להשתמש בתוכנית, אתה צריך קובץ קלט המכיל את החלבון קידוד רצפים DNA (ראה Rnase.Seq עבור דוגמה). קובץ זה מתחיל עם שני מספרים: מספר רצפים ומספר נוקליאוטידים לכל רצף (אורך רצף). השורה השנייה תהיה שם הרצף הראשון, והקו השלישי יהיה הרצף הראשון, וכן הלאה. רק A, G, C, T, A, G, C, ו- T מותרים. יש להסיר פערים ורצפים יש מיושר מראש. רצפים צריך רק לכלול אזורים קידוד חלבון, עם קודים עצור הוסרו.

NG-New. תוכנה קשורה