Mcrate

חישוב שיעור אבולוציוני יחסית בעזרת כלי זה.
הורד עכשיו

Mcrate דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • Freeware
  • שם המפרסם:
  • Itay Mayrose
  • מערכות הפעלה:
  • Windows All
  • גודל הקובץ:
  • 411 KB

Mcrate תגים


Mcrate תיאור

התואר שבו אתר חומצה אמינו חופשי להשתנות תלויה חזקה בחשיבות המבנית והתפקודית שלה. חומצת אמינו שממיצה תפקיד חיוני, כגון אחד בתוך האתר הפעיל של החלבון, לא סביר לשנות את הזמן האבולוציוני. לפיכך, שיעור האבולוציוני באתר חומצה אמינו מעיד על האופן שבו שומר אתר זה הוא, ובתורם, מאפשר הערכת החשיבות של אתר זה בשמירה על המבנה או הפונקציה של החלבון. MCRATE הוא שימושי, קל לשימוש בכלי שתוכנן במיוחד כדי לחשב את שיעור אבולוציוני יחסית בכל אתר באמצעות מודל אבולוציוני המבוסס הסתברותי. זה מאפשר לקחת בחשבון את התהליך stochastic הבסיס האבולוציה של רצף בתוך משפחות חלבון. והכי חשוב, MCRATE משתמשת Markov שרשרת Monte Carlo (MCMC) מתודולוגיה להשתלב על שטח של כל העצים האפשריים. לפיכך, MCRATE אינו מניח עץ phylogenetic קיים לפני אשר רצפים להתייחס. MCRATE נמצא להיות מעולה על NA? VE שיטות להסתמך על עץ אחד בלבד.


Mcrate תוכנה קשורה