Cytoseed

ניהול הדגמים המטבוליים שלך בעזרת כלי זה
הורד עכשיו

Cytoseed דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • GPL
  • שם המפרסם:
  • Matt DeJongh
  • מערכות הפעלה:
  • Windows XP / Vista / 7
  • גודל הקובץ:
  • 3.2 MB

Cytoseed תגים


Cytoseed תיאור

Cytoseed נבנה כמו תוסף cytoscape שיכול לעזור לך להציג, לתפעל ולנתח מודלים מטבוליים שנוצרו באמצעות זרע המודל. התוסף Cytoseed תוכנן על מנת לאפשר למשתמשים של זרעי המודל כדי ליצור חזות אינפורמטיבי של רשתות התגובה שנוצרו עבור האורגניזמים שלהם של עניין. משתמשים יכולים לטעון כל דגם שעבורו יש להם גישה בזרע הדגם. תוסף Cytoseed מוריד את נתוני המודל, התגובות והתרכובות של זרע המודל, ומארגנים את התגובות לרשתות המבוססות על מפות Kegg המקביל שלהם. לאחר העומס הראשוני (אשר עשוי להימשך מספר דקות), נתוני המודל מאוחסנים בשולחן העבודה של המשתמש בתיקייה שצוינה עבור טעינה מהירה בפגישות הבאות. תכונות עיקריות: הורדת מודלים מן הדגם זרע; יצירת מפגשי ציטוסקיפ לצפייה במודלים; חיסכון ופתיחת הפעלות cytoscape יצירת ומחיקה של מפות מסלול; העברת / העתקת תגובות בין מפות מסלול; הסתרה / מראה צמתים במסלול מפות ויזואליזציה של ניתוח משתנים משתנים תוצאות מספר מדיה; תגובות צבעוניות מבוססות על חיוני / פעיל / לא פעילים / מפלגות מלאות יכולת לפתוח מודלים עבור מספר אורגניזמים באחד מושב Cytoscape, כדי לאפשר ניתוח מודל השוואתי ויזואליזציה של תוצאות ניתוח מאזן השטף


Cytoseed תוכנה קשורה