Cmview.

יצירת קשר מפת ויזואליזציה קלה.
הורד עכשיו

Cmview. דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • Freeware
  • שם המפרסם:
  • Max-Planck Institute for Informatics
  • גודל הקובץ:
  • 2.4 MB

Cmview. תגים


Cmview. תיאור

CMView הוא שימושי, קל לשימוש, מבוסס ג 'אווה, קשר אינטראקטיבי ויזואליזציה וניתוח יישום. CMView היא כלי תוכנה לדמיין ולנתח את הרשת של אנשי קשר בין שאריות חומצות אמינו במבנה חלבון. רשמית, רשת זו היא גרף שבו כל שאריות תואמת צומת ושני צמתים מחוברים על ידי קצה אם ורק אם שני שאריות נמצאות במגע. שני שאריות נחשבים במגע אם הם קרובים מאוד במבנה התלת-ממדי. ב CMView הגדרת מגע מוגדר על ידי שני פרמטרים: סוג הקשר והמרחק לחתוך. סוג הקשר מגדיר קבוצת משנה של אטומים של שאריות. שני שאריות אני ו j הם אז במגע אם שני אטומים מתוך זה משנה, אחד ממני ואחד מ J, לא רחוק יותר מאשר את המרחק. התיאור של רשת הקשר כמטריצה (רשמית, מטריצת השמלה של גרף איש הקשר) נקראת מפת קשר. תכונות עיקריות: משולב מפת קשר ותצוגת מבנה 3D (באמצעות Pymol) אפשרויות שונות ויצוא: קבצי PDB, PDB מקוון, ייצוא תמונה, פורמט חיזוי CASP ועוד חישוב מפות אנשי קשר עם הגדרות מגע מוגדרות על ידי המשתמש אינטגרציה עם Pymol עבור תכונה עשירה 3D הדמיה מולקולרית מבנה ויצירת קשר השוואה באמצעות ברצף מובנה או יישור מבני מפה מרחק, מפה ההבדל, ניתוח צפיפות מגע


Cmview. תוכנה קשורה

עלינו