ימוטו

ברקוד DNA רצף ניתוח נתונים קל.
הורד עכשיו

ימוטו דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • Freeware
  • שם המפרסם:
  • Mark Blaxter
  • מערכות הפעלה:
  • Windows All
  • גודל הקובץ:
  • 7.1 MB

ימוטו תגים


ימוטו תיאור

JMOTU הוא שימושי, קל לשימוש החבילה שנועדו במיוחד כדי לעזור לך אשכול ברקוד DNA רצף נתונים לתוך יחידות טלקונומיות תפעולית מולקולרית (מוטו). אם אתה לא בטוח מה מוטו הוא, בבקשה לראות את דפי barcoding דנ"א באתר האינטרנט שלנו. JMOTU עושה את הפעולות הבאות: · קורא רצפי קלט בפורמט FASTA או Nexus · מחשבת מרחקים בין זוגות רצפים באמצעות שילוב של הפיצוץ לבין חומרי היישור הגלובלי של הציפורים · אשכולות קלט רצפים לתוך מוטו באמצעות אמצעים חותך שונים JMOTU יכול לעבד נתונים מערכים גדולים ומשתמשת בשלב של שלבים סינון כדי למזער את מספר היישור הגלובלי המדויק שיש לבצע. בעת חישוב מרחקים זוגי, Jmotu מתעלם פערים וספירה רק נוקליאוטיד שגוי התאמות, מה שהופך אותו חזק יחסית לשגיאות רצף הנגרמת על ידי פועל homopolymer. אשכולות מתבצעת באמצעות אלגוריתם חמדן שאינו תלוי בסדר רצף קלט. JMOTU נבדק על נתונים גולמיים של כ -50,000 רצפים קלט, והוא יכול לקשור נתונים גדולים יותר על ידי preforming prevlustering של קבוצות נתונים לפני שילובם לניתוח גלובלי.


ימוטו תוכנה קשורה