| טכניקה SVM להעריך פפטידים poteotypic Stepp הוא הערכת כלי פפטידים petteytypic. |
הורד עכשיו |
טכניקה SVM להעריך פפטידים poteotypic דירוג וסיכום
- שם המפרסם:
- Pacific Northwest National Laboratory
- אתר האינטרנט של המוציא לאור:
- מערכות הפעלה:
- Windows XP/2000/98
טכניקה SVM להעריך פפטידים poteotypic תגים
טכניקה SVM להעריך פפטידים poteotypic תיאור
תוכנת סטפ מכילה יישום של SVM מאומן (תמיכה וקטור תמיכה) שיכול לחשב ציון המייצג איך "porteotypic" פפטיד הוא על ידי LC-MS. התוכנית יכולה לקרוא קובץ חלבון, לבצע עיכול סיליקון, ולחשוב את ציון היציבות עבור כל פפטיד טריסטי או טריפטי חלקית. שים לב כי ציונים גדול יותר (חיובי) אומר פפטיד הוא חזה להיות יותר porteotypic בעוד נמוך (שלילי) ציונים אומר פפטיד לא ניבא להיות porteotypic. מודל SVM בשימוש על ידי Stepp הוא שטח מתאר פשוט מבוסס על 35 תכונות של תוכן חומצת אמינו, תשלום, הידרופיליות, וטפיטיות עבור חיזוי כמותי של פפטידים porteotypic. המודל הוכשר ואושר עם שלושה מסדי נתונים של AMT נוגעים באופן עצמאי (Sheewanella Oneidensis, Salmonella Typhimurium, Pestis Yersinia). SVM הביא למדוד דיוק ממוצע של 0.8 עם סטיית תקן של פחות מ 0.025.
טכניקה SVM להעריך פפטידים poteotypic תוכנה קשורה