הֵאֶה

עוד כלי ביואינפורמטיקה כדי לעזור לך עם העבודה שלך.
הורד עכשיו

הֵאֶה דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • GPL
  • שם המפרסם:
  • Jianjiong Gao
  • גודל הקובץ:
  • 13.4 MB

הֵאֶה תגים


הֵאֶה תיאור

Musite היא קלה לשימוש, יישום מבוסס Java שנועד להציע כלי ביואינפורמטיקה לניבוי אתרי חלבון כללי וקינאז ספציפי. תכונות עיקריות: כדי להתמודד עם המגבלות השונות של הכלים הנוכחיים בעת החלת פרוטאומים כדי לנצל טוב יותר את גודל גדול של אתרי זרחן מאומת מבחינה ניסוי, פיתחנו מערכת יישום עצמאית ייחודית, שתוכננה במיוחד עבור חיזוי בקנה מידה גדול של שניהם כללי שניהם ואת אתרי פוספוריה ספציפיים קינאז. Musite ניצל דפוסי הדמיון המקומיים (ציוני Knn) ותכונות כלליות (ציונים הפרעות ותדרי חומצות אמינו) של אתרי זרחניים, והעסיק גישה מקיפה למידה למידה כדי ליצור תחזיות. אישרנו את הממצא הקודם כי אתרי פוספוריה ממוקמים באופן מועדף באזורים מסולפים על נתוני פוספופרוטומיה בשש אורגניזמים. Musite הוא הכלי הראשון המספק את השירות לאימון מודל חיזוי פוספוריזציה של אתר של המשתמשים, ותומך בהתאמה מתמשכת של רמות החדרות. Musite מספק ממשק משתמש גרפי ידידותי למשתמש, מה שהופך אותו קל לביולוגים לבצע תחזיות באופנה אוטומטית. יישומים של Musite על שישה proteomes הניבו עשרות אלפי אתרי פוספוריזציה עם חירות גבוהה. תחזיות אלה מספקות היפותזות שימושיות לאימות ניסיוני. בדיקות Cross-Validation מראים כי Musite מבצעים באופן משמעותי את הכלים הקיימים לחיזוי אתרי זרחן כללי, והוא לפחות להשוות לאלו לחיזוי אתרי זרחן ספציפיים לקינאז. יתר על כן, בתור תוכנה קוד פתוח, Musite ניתן גם שימש פלטפורמה פתוחה לבניית מכונת למידה עבור חיזוי לאתר פוספציה.


הֵאֶה תוכנה קשורה