דנ"א הדרקון

DNA רצף קונטיג אסמבלר תוכנה
הורד עכשיו

דנ"א הדרקון דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • Trial
  • שם המפרסם:
  • SequentiX
  • גודל הקובץ:
  • 486 KB

דנ"א הדרקון תגים


דנ"א הדרקון תיאור

DNA הדרקון הוא כלי DNA מתקדם שיכול להתמודד עם יותר מ 100,000 דגימות פורמטי רצף (FASTA, EMBL, GenBank, וכו '), פורמטים של קבצי עקבות (SCF, ABI, AB1) ו פורמטים של קבצי רצף הדור הבא (Illumina, SFF, GFF , וכו). הערה : הניסוי יכול להיות מופעל באמצעות "כפתור רישיון" בתוכנה. תכונות עיקריות: קריאות הפורמטים רצף הפופולרי ביותר:. (FASTA, GenBank, EMBL, SCF, ABI, AB1, SSF, הדור הבא) מרובים זמירה תכונות:. וקטורית, איכות ואורך זמירה Fast הרכבת ידיות מכונת פרויקטים עם יותר מ 100,000 רצפים. פורמטים של קבצים נתמכים: קבצי הפרויקט: פרויקט XML DNA הדרקון XML (* .xml) פורמטים של קבצים רצף: EMBL (* .eb;. * EBI;. * EMBL) GenBank (* .gb; * gen;. * GenBank;.. * Txt) FASTA (* .fa; * FAS;. * מהיר;. * Fasta;. * FS;. * FSA;.. * FSTA) פורמטים של קבצים רצף הדור הבא: קבצים מוצקים ABI (* .gff) קבצי CSFASTA מוצקים (* .csfasta) פורמט קריאה Solexa קומפקט ASCII, צעיף (s _ * _ sequence.txt) Illumina _seq.txt קבצים (* .txt) קבצים Illumina FASTQ (* .fastq) קבצים Qseq Illumina (* _qseq.txt) 454 קבצי flowgram סטנדרטיים (* .sff) פורמטים של קבצים יישור: מפה / יישור רצף (SAM) פורמט (* .sam) פורמט יישור בינארי (* .bam) (* .bam) פורמטים של קבצי עקבות: SCF (* .scf) ABI (* .abi;. * Ab1) עץ Navigator: מדגם נווט עץ הופך את מבנה הפרויקט (contigs ודגימות) מאוד ברור. מכאן דגימות נבחרות, אז גזוז והרכיבו. זמירה ותכונות untrimming: Primer-Clipping וקטור-Clipping עם pseudocircularization אוטומטית (50 בסיסים). אתה יכול לזהות מוטיבים וקטור המשוערת רצפים ללא כל ידע קודם. רצף איכות מבוססת זמירה אורך זמירה Untimming:. ושחזורי קצוות הועתקו עצרת מכונית ועורך contig: אפשרויות שונות כדי לשנות את הפרמטרים הרכבה זמינים. הדרך המהירה, מדד המבוסס הרכבה של רצפים עם מיון האוטומטי של הרצפים בתוך contigs (לקזז קצות קצוות) הופך את ניהול פרויקטי תענוג. הגהת של contigs (יישור רצף), דהיינו השוואה של בסיסים עם עקבות שלהם, ואת הייצוא / להעתיק את רצפי הקונצנזוס הוא כמעט מובן מאליו.


דנ"א הדרקון תוכנה קשורה

AVL

מודל וורטקס-סריג המתאים ביותר עבור תצורות אווירודינמיות אשר מורכב בעיקר של הרמה דקה ... ...

528 311 KB

הורד

Simdiv

יצירת ערכות נתונים תחת בידוד עם מודל הגירה ...

264 103 KB

הורד