| אקספרס לזהות הרגולטורים במעלה הזרם סביר להניח שינון שנצפו בביטוי הגנום של הגנום. |
הורד עכשיו |
אקספרס דירוג וסיכום
- שם המפרסם:
- By Mount Sinai School of Medicine Ma'ayan
- אתר האינטרנט של המוציא לאור:
- http://www.mssm.edu/labs/maayan
- מערכות הפעלה:
- Windows 98/Me/2000/XP/2003/Vista/Server 2008/7/NT
- דרישות נוספות:
- Java Runtime Environment 6.0
אקספרס תגים
אקספרס תיאור
פרופיל MRNA של הגנום מספק תמונה של מצב תאים גלובלי בתנאים שונים. עם זאת, רמות MRNA לא מספקים הבנה ישירה של מנגנונים רגולטוריים במעלה. Expression2kinases (X2K) היא גישה חדשה לזהות הרגולטורים במעלה הזרם סביר שאחראי על שינויים שנצפו בביטוי הגנום של הגנום. על ידי שילוב שבב-SEQ / שבב ומיקומים-מטריצות-מטריצות (PWMS), אינטראקציות חלבון חלבון, ותגובות זרחן של קינאז-מצע X2K ניתן להשתמש כדי לזהות מנגנונים רגולטוריים במעלה ההבדלים בגנו של הגנום. הרעיון הוא להסיק הראשון גורמי התעתיק סביר ביותר להסדיר את ההבדלים בביטוי גנים, ולאחר מכן להשתמש אינטראקציות חלבון חלבון כדי לחבר את גורמי שעתוק מזוהים באמצעות חלבונים נוספים לבניית בניין subnetworks רגולטורית מתמקדים, ולבסוף להשתמש Kinase- מצע תגובות חלבון פוספוריה, לזהות ולדרג את המועמד חלבון- Kinases כי סביר להניח להסדיר את היווצרות של מתחמי תעתיק מזוהים. X2K מכיל גם כלים לביצוע ניתוח העשרה ברשימת הגנים ולחזות תרופות שיכולות להפוך או להחמיר שינויים בביטוי הגן. הגישה X2K יכולה לקדם את ההבנה שלנו של אותות תא ו unravel סמים מנגנונים של פעולה.
אקספרס תוכנה קשורה