Pyrx הצג נתונים מולקולריים עם כלי זה
הורד עכשיו

Pyrx דירוג וסיכום

Pyrx תגים

לְנַתֵחַ analyzer מולדולה מולקולה הצופה מנתח מטרות תרופות תהליך גילוי סמים

Pyrx תיאור

הצג נתונים מולקולריים עם הכלי הזה Pyrx הוא קל לשימוש וירטואלי יישום הקרנה המיועדת במיוחד עבור תגלית סמים חישובית, כי ניתן להשתמש בספריות המסך של תרכובות נגד מטרות סמים פוטנציאליים. PYRX מאפשר כימאים מרפא להפעיל את ההקרנה הווירטואלית טופס כל פלטפורמה ומסייע למשתמשים בכל שלב של תהליך זה - מתוך הכנת נתונים להגשת עבודה וניתוח של התוצאות. אמנם זה נכון כי אין כפתור קסם בתהליך גילוי סמים, Pyrx כולל אשף עגינה עם ממשק משתמש קל לשימוש אשר עושה את זה כלי חשוב עבור עיצוב סמים בעזרת המחשב. PYRX כולל גם פונקציונליות דמוית גיליון אלקטרוני כימי וחזק חזותית עוצמה כי הם חיוניים עבור עיצוב סמים רציונלי. מה חדש במהדורה זו: הוסיף שמור כערכים מופרדים בפסיקים (CSV) עבור שולחנות מסד נתונים. · הוסיף תכונה מתכננת עבור שולחנות מסד נתונים. ניתן לגשת לתכונה זו באמצעות לחצן סרגל כלים תחת Table Tab. כברירת מחדל, הוא פותח את תיבת הדו שיח טבלת שולחן שבו בר מזימה של אנרגיה מחייב לעומת ליגנד (אינדקס) מוצג. אם יש לך PUBCHEM BIOASSAY נפתח באמצעות לחצן CVS פתוח, יישומון זה גם לבדוק אם יש טור תוצאה בטבלה, ואם כן, זה יהיה צבע ברים המתאים "פעיל" תרכובת אדום וברים המתאים "לא פעילה" כחול כחול . · שינה שדה ברירת מחדל כוח עבור פתח Babel Energy Minimization מ UFF ל MMFF94. · שינוי ברירת המחדל עבור מספר מרבי של הערכות אנרגיה (פרמטר אלגוריתם גנרי ב- Autodock) מ בינונית (GA_NUM_EVALS = 2500000) כדי קצר (GA_NUM_EVALS = 250000). נוסף AutoDock PBS הגשת תשלום התקדמות התקדמות. · תוקן באג שגורם לבעיות בעת הצגת משטחים מולקולריים עבור קונפורמציות מעוגנות. הוסיפו שיח לבחירת קונפורמציה חלופית בעת ביצוע קובץ Macromolecule (PDBQT) עבור AutoDock. · מאופשר סוכן איכותי של סוכן שניתן להשתמש בו כדי לקבל דוח באגים והערות ממשתמש. · אפשרות ביטול נוסף עבור שירותי אינטרנט autogrid. · מיושם שאריות גמישות עבור AutoDock. תכונה זו יכולה להיות גישה על ידי בחירת שאריות (ים) תחת נווט-> מולקולות ולחיצה ימנית עליהם. בחר Autodock -> שאריות גמישות כדי ליצור תיקייה _Flex תחת Navigator -> Autodock -> Macromolecules עם קולטן Pdbqt ו Flex.pdbqt. כל עגינה לקולטן זה נעשה אז עם שאריות גמישות זו (ים). · מעודכן פייתון לגרסה 2.6 ו ets ל 3.4.0.

Pyrx תוכנה קשורה