Padel- מתאר מחשבת תארי טביעות אצבעות מולקולריות
הורד עכשיו

Padel- מתאר דירוג וסיכום

Padel- מתאר תגים

לחשב טביעת אצבע מתאר מחשבון מתאר מחשבון טביעות אצבע

Padel- מתאר תיאור

מחשבת מתארות מולקולריות וטביעות אצבעות Padel-מתאר הוא תוכנת Java שיכולים לחשב את התיאורים המולקולריים ואת טביעות האצבעות. Padel- מתאר מחשבים כרגע 404 מתארי (2701D, 2D מתארי 134 מתארי 3D) ו -7 סוגי טביעות אצבע (ברירת המחדל הנוכחית מחשבת רק את סט של טביעות אצבע). התיאורים ואת טביעות האצבעות מחושבים באמצעות ערכת פיתוח כימיה עם כמה תוספת פנים עבור תיאורים electrotopological.Usage: · בחר את הספרייה המכילה את הקבצים המבניים של מולקולות. פורמטי הקבצים הנפוצים ביותר (למשל Mol Mol, חיוכים, PDB) נתמכים אך בפורמט הקובץ המומלץ הוא MDL MOL. בחר קובץ כדי לשמור את התיאורים המחושבים. התיאורים יישמרו בפורמט קובץ מופרד בפסיק (CSV). השורה הראשונה היא שורת הכותרת. השורות הבאות יכילו את התיאורים המחושבים עבור מולקולה אחת לשורה. הטור הראשון הוא שמו של המולקולה, אשר מתקבל גם מהקובץ המבני או Outogenerated (יהיה קידומת עם Autogen_ ואחריו שם הקובץ). עמודות עוקבות הן התיאורים למולקולות. · בדוק את האפשרות "1D ו- 2D" אם ברצונך לחשב את התיאורים 1D ו- 2D. · בדוק את האפשרות "3D" אם ברצונך לחשב את התיאורים 3D. · בדוק את האפשרות "טביעות אצבע" אם ברצונך לחשב טביעות אצבע. · בדוק את האפשרות "הסר מלח" אם ברצונך להסיר מלחים כמו NA, CL מן המולקולה לפני חישוב התיאורים. עדיף להסיר מלחים מן המולקולה באמצעות האמצעים שלך מאשר להסתמך על תוכנה זו כדי לעשות את העבודה. · בדוק את האפשרות "הוסף מימן" אם אתה רוצה להוסיף הידרוגנים מפורשים, אשר נדרשים על ידי כמה אלגוריתמים חישוב מתאר, לפני חישוב התיאורים. עדיף להוסיף הידרוגנים מפורשים באמצעות האמצעים שלך מאשר להסתמך על תוכנה זו כדי לעשות את העבודה. · בדוק את האפשרות "להמיר 3D" אם אתה רוצה להמיר את המולקולה ל 3D לפני חישוב התיאורים. עדיף להמיר את המולקולה ל 3D באמצעות האמצעים שלך מאשר להסתמך על תוכנה זו כדי לעשות את העבודה. · הזן ערך (גדול מ -0) עבור האפשרות "תרכובות מקסימום לכל קובץ" אם ברצונך להגביל את המספר המרבי של תרכובות כדי להישמר בקובץ מתאר. זה שימושי להגבלת גודל קובץ מתאר ועזרת למנוע האטה של חישוב מתאר עקב כתיבה של ערכים מתאר חדשים לקובץ מתאר גדול. · אם ברצונך לבחור את סוגי התיאורים או טביעות האצבעות שיש לחושב , אתה יכול לערוך את הקובץ התיאומיות פשוט לשנות את התכונה 'ערך' של מתאר 'true' כדי להפעיל אותו ו 'שקר' כדי לכבות אותו. אלה המפעילים תוכנה זו באמצעות התחל אינטרנט Java יצטרכו להוריד את התיאוריות דרישות: · ג 'אווה 1.6 ואילך מה חדש במהדורה זו: · באג קבוע אשר גורם שגיאות חריגות Java אם הקובץ כדי לחסוך מתארים אין תוסף קובץ.

Padel- מתאר תוכנה קשורה