Molekel קוד חופשי ופתח להדמיה מולקולרית עבור Mac שלך
הורד עכשיו

Molekel דירוג וסיכום

Molekel תגים

לַחֲזוֹת מכשיר חזותי לדמיין את המולקולה מולדולה מולקולה Visualizer. מולקולה ויזואליזציה

Molekel תיאור

קוד חינם ומקור פתוח מולקולרית יישום עבור Mac שלך Molekel הוא קוד פתוח, קל לשימוש חינם רב פלטפורמה מולקולרית תוכנית ההדמיה. הנה כמה תכונות עיקריות של "Molekel": · קרא נתונים מולקולריים מתוך פורמטים שונים של קבצים · להציג מולקולות עם סגנונות שונים: Mindfill, כדור מקל, כדור חוט, מקל, עמוד השדרה (שאריות), סרט (שאריות), סכמטי (שאריות) · שינוי אטום וגודל האג"ח · לקרוא צבעים אטום מקובץ · להציג רגע דיפול (עבור פורמטים מולקולריים המכילים מידע זה) · הנפשת אטומים באמצעות מסלול ומידע רטט זמין בכמה פורמטים של קבצים · הנפשת מולקולות לקרוא מ multi-frame pdb ו xyz קבצים · להציג את החצים כדי להציג את המהירות ואת הכיוון של תנועה של כל אטום אנימציה · הנפשת משטחים מולקולריים (תוך ייצוא עמעום) · ביצוע מרחק ו (Dihedral) זווית חישובים · השתמש בדיקה מישורית כדי לדמיין שדות Scalar (E.G. פוטנציאל אלקטרוסטטי) ולהציג את הערך של שדה Scalar בנקודה מסוימת בחלל 3D. · לדמיין את משטחי ISO מולקולרית ORBITAL אופציונלי לקודד עם פוטנציאל אלקטרוסטטי. · לדמיין משטחים שנוצרו מטריקס צפיפות אופציונלי מקודד עם פוטנציאל אלקטרוסטטי. · לדמיין משטחים מנתוני רשת (בפורמט קוביית גאוס או לקרוא מ- ADF Tape41 קבצים) אופציונלי מקודד עם פוטנציאל אלקטרוסטטי. · משטחים חלקים שנוצרו מנתוני רשת (גאוס .Cube) עם החלקה laplacian · השתמש בנתוני רשת לקרוא מ. קובצי Acube כמו פוטנציאל אלקטרוסטטי מולקולרי למפה על גבי SAS ו SES משטחים · לחשב משטח נגיש ממס כמו ISO- משטח אופציונלי מקודד עם פוטנציאל אלקטרוסטטי. · לחשב ולהציג ממס משטח נשלל, אופציונלי באמצעות M.F. תוכנית MSS של Sanner (מומלץ מאוד), לקבל את זה כאן · ייצוא מולקולה למספר פורמטים של קבצים מולקולריים · ייצוא ל- POV (ניסיוני, באמצעות OpenBabel) · ייצוא ל- TIFF, PNG, PostScript ו- PDF · Supports לתכנות (GLSL) תמיכה · ויזואליזציה של ספקטרום קרינה (אינפרא אדום ורמאן) · באיכות גבוהה רב עיבוד רב עם עיבוד אנטי aliasing ונכונה של משטחים שקופים רב שכבתיים · מיזוג של מצבי vibrational מה חדש במהדורה זו: · תמיכה נוספת לקילוף עומק עבור עיבוד נכון של אובייקטים שקופים; דורש כרטיס OpenGL 2.0 ואולי לא יפעל כראוי במערכות מסוימות. פרמטרים קילוף עומק המשפיעים על מהירות / איכות אובייקטים שקופים ניתן להגדיר באמצעות תיבת הדו-שיח 'תצוגה' מאפיינים '. · נוסף מגרש של ספקטרום אינפרא אדום ורמאן עם פלט PostScript ו- PDF · משולבת עם VTK 5.1 (גירסת CVS מאז אין שחרור רשמי עדיין) · תמיכה נוספת עבור Anti-aliasing, מושבת כברירת מחדל; יכול להיות מופעל באמצעות תיבת הדו-שיח 'תצוגה'). · אפשר לשנות את השקיפות והצבעים של משטחים מסלוליים. · תמיכה נוספת להגדרות מתמשכות בתיבת הדו-שיח 'צפיפות אלקטרונים'. · נוסף חדש רנטגן Shaders לעבוד כראוי עם VTK 5.1. חרקים קבועים: · 392 - הוסף תמיכה עבור קלט מרובה מולקולה · 401 - לא ניתן למחוק משטח קונולי · 403 - תמיכה בשורת הפקודה · 404 - קריאת מסלולים מולקולריים · 405 - שקיפות לא עולה בקנה אחד עבור צבעי אורביטליים (תלוי בכרטיס מסוים / מנהל התקן) · 406 - אנימציה פועל לאחר מחיקת המולקולה · 408 - בקשה תכונה: הפעלת אינדקס מסלולית מאפס · 420 - הגדרות לא נשמרות בעת סגירת חלון · 421 - משטח מנתוני רשת: זמן שחלף דוח שגוי · 422 - לא ניתן לשמור אנימציות עם SES שקוף

Molekel תוכנה קשורה