 | Kegg2sbml.שירות שורת הפקודה יכול להמיר קבצי מסד נתונים של Kegg Pathway SBML |
| הורד עכשיו | |
Kegg2sbml. דירוג וסיכום
פרסומת
- רישיון:
- Freeware
- מחיר:
- FREE
- שם המפרסם:
- SBML Team
- אתר האינטרנט של המוציא לאור:
- http://sbml.org/Main_Page
- מערכות הפעלה:
- Mac OS X
- גודל הקובץ:
- 51 KB
Kegg2sbml. תגים
Kegg2sbml. תיאור
כלי שורת הפקודה יכול להמיר קבצי מסד נתונים של Kegg Pathway SBML Kegg2SBML יכול להמיר Kegg (קיוטו אנציקלופדיה של גנים וגנומים) שביל מסד נתונים קבצים SBML באמצעות מסד הנתונים של Kegg Ligand. היכולות של Kegg2SBML מוגבלות כרגע להמרת קבצי נתיב Kegg Metabolic ולא סוגים אחרים של Kegg Files.keggg2sbml יכול להמיר את מסד הנתונים של Kegg Pathway שחרור 46.0 או מאוחר יותר. (הודעות קודמות של מסד הנתונים של Kegg Pathway לא נבדקו ולא ניתן להמיר על ידי Kegg2SBML.) Kegg2SBML יכול ליצור רמה SBML 2 גרסה 2 ו רמה 2 גרסה 3 ללא הערות בשימוש על ידי celldesigner ורמה 1 ורמה 2 (גרסה 1), עם או ללא הערות מה חדש במהדורה זו: שינויים בנתח שביתת Kegg: · Segg Pathway Drayse שחרור 46.0 או מאוחר יותר ניתן להמיר. (הודעות קודמות של מסד הנתונים של Kegg Pathway לא ניתן להמיר על ידי KEGG2SBML גרסה 1.5.0). · קובץ פורמט נוסף (* .coord) נתמך · קובץ פורמט קיים (* .conf) נתמך גם. אפשרות אפשרות ניתן להשתמש כדי להשתמש במפורש בפורמט זה. · * קובץ CoorD הוא מנותח במקום * קובץ. Conf כברירת מחדל שינויים בנתח kegg ligand: · שיפור ביצועים על ידי אחסון טבלת חשיש לקבצי המטמון ולקריאת קבצי מטמון אלה במקום לנתח קבצי Lignad מסד נתונים (בערך 10 פעמים מהר יותר לנתח ליגנד מסד נתונים) שינויים בכתיבת SBML: · SBML רמה 2 גרסה 2 ורמה 2 גרסה 3 נתמכים. (כיום, תגים ביאור CellDesigner אינם נתמכים עם רמת SBML / גרסה אלה). אפשרויות נוספות: · '-R': לנתח קבצי מסד נתונים ליגנד במקום לקרוא קבצים מטמון בינארי הממוקם באותה ספרייה. (ברירת מחדל: קרא קבצי מטמון (* .bin)) · '-O': Parse * קבצים. Conform במקום *. קובצי COORD כאשר שם ספרייה ניתנת כארגומנט או אפשרות מוגדר. (ברירת מחדל: Parse * קבצים. · KGML אינו משמש עוד מהדורה זו. · שיפורים ותיקונים אחרים.
Kegg2sbml. תוכנה קשורה
