Bioimagexd. תוכנת קוד פתוח חינם לניתוח והדמיה של תמונות ביו-רפואיות רב-ממדיות
הורד עכשיו

Bioimagexd. דירוג וסיכום

Bioimagexd. תגים

לְנַתֵחַ אָנָלִיזָה analyzer לנתח תמונה biomedial. דמיינו תמונה ביו-רפואית ניתוח תמונה ביו-רפואי

Bioimagexd. תיאור

תוכנת קוד פתוח חינם לניתוח והדמיה של תמונות ביו-רפואיות רב-ממדיות BIOIMAGEXD היא תוכנה חופשית קוד פתוח שיסייע לך לנתח, לעבד ולעסור רב ממדי, ערוץ נתונים רב, נתונים סדרת נתוני תמונה מ מיקרוסקופ ומקורות אחרים. הנה כמה תכונות עיקריות של "bioimagexd": צפייה בתמונה: פתח נתונים בפורמטים מיקרוסקופיים נפוצים (או תמונות או ערימות של תמונות וסדרת זמן), ומציגים את תמונת הנתונים לפי תמונה. פורמטים נתמכים בנתונים כוללים: · Carl Zeiss קבצים · OLYMPUSFV1000 Leica confocal מיקרוסקופ נתונים קבצים SP2 .txt ו sp5 · מספר ערימות תמונה ממוספרת · VTK XML קבצי תמונה · צפייה בתמונה היא דומה בערך לחינם קרל Zeiss ו צופים אחרים confocal יצרן תמונה, אבל עם טיוח 3D טוב יותר. מצבי צפייה avaialble הם: פרוסות, חלקים אורתוגרפיים, הקרנת אינטנסיביות מקסימלית ו 3D טיוח. נתונים סדרת זמן נתמכים. עיבוד תמונה: · התאמת צבע / בהירות / ניגודיות / גמא, לשנות צבע או לוח של מערך נתונים / ערוץ, לסנן את הרעש, לתקן הלבנה פלואורסצנטי בנתוני סדרה בזמן. · פילוח 3D אובייקט ananlysis. עיבוד נפח 3D: · 3D DataSets יכול להיות נפח אינטראקטיבי שניתנו, באמצעות · הליהוק רנטגן תוכנה (איטי אבל יפה ביותר. Aclerated על ידי מעבדים רבים) · מיפוי כרטיס גרפיקה של OpenGL (מהר יותר אך נמוך יותר - בהתאם לגודל המרקם) · TerareCon Inc. · פונקציות העברת הצבע והאטימות מוגדרות למשתמש. אתה יכול נפח לדקלם ערוץ מרובי ממוזג RGB Dataset לראות colocalisation ב 3D, או לדקלם מפת colocalisation 3D. BIOIMAGEXD משתמש בממשק VTK עם OpenGL. אנו מתכננים לאפשר צפייה סטריאו של חומרה (מרפרף שנאגרף מדפדף ואדום כחול anaglyph, ומצבים אחרים). תוכל לפרוץ את אלה משקפיים 3D באמת "לראות" את הנתונים שלך! זהו העתיד של מיקרוסקופיה 3D. הכנת סרט: · השתמש במודול האנימטור כדי להגדיר נתיב מצלמה סביב נתוני התלת-ממד שלך, ולעשות סרט של אותו מסתובב ועוף למרות שתרצה בכל דרך שתרצה. נתונים סדרת נתונים נתמכים: "נתונים 4D". · ניתוח קולקליזציה · אנחנו יודעים את כל הביולוגים התא באמצעות מיקרוסקופיה confocal תמיד מחפשים colocalisation! כלי colocalisation שלנו מאפשר לך לנתח את colocalisation של עוצמת האות במערכת נתונים רב ערוצית 3D, הימנעות מבעיה של colocalisation שווא לראות תמונות z- מחסנית הקרנה, ולבצע כמה ניתוחים סטטיסטיים שנותנים לך מספרים קשים על הסכום והאיכות של colocalisation בנתונים שלך. משתמש באלגוריתמים דומים לאלו ב- ImageJ, למשל את תוסף WCIF עבור סף קולקליזציה אוטומטית, תוך שימוש בשיטת תהליכים ואח '. · מקדמי מנדרים וניתוח חשיבות סטטיסטית, עם היסטוגרמה / פיזור ויצוא לסטטיסטיקה

Bioimagexd. תוכנה קשורה