רצועה תוכנית Java ידידותית למשתמש מיישרת חלבונים לפי רצף ומבנה 3D
הורד עכשיו

רצועה דירוג וסיכום

רצועה תגים

חֶלְבּוֹן ליישר ביולוגיה ליישר חלבון רצף MRNA. ביאור חלבון

רצועה תיאור

תוכנית ידידותית למשתמש Java שמיישר חלבונים לפי רצף ומבנה 3D רצועה היא תוכנית חוצה פלטפורמה התומכת בניתוח סימולטני של מאות חלבונים ומשלבת רצף חומצות אמינו, מבנה 3D ו Genomic- ו- MRNA- רצף, מבנה משני ואת שאריות ביאור. יישור יכול להיות מיוצא ושונה ב- MS-Word או מעבדי טקסט אחרים הדרכה כלל ילמד את השימוש של רצועה בתוך שעה קטנה. כתיבת כתיבת הרווחת להפוך את הכלי חזק מאוד עבור אפילו את המשתמשים המתקדמים ביותר. הנה כמה תכונות עיקריות של "רצועה": · חישוב של יישור רצף · חישוב של ויקי: 3D-superpositions (לדוגמה פלט) ומבנה מבוסס יישור מרובים של חלבונים עם PubMed: tm-align או לסה"נ או gangsta + 3D-superposition. יישור ברצף משולב. · 3D ויזואליזציה באמצעות ויקי: Pymol או Wiki: JMol או Rasmol ו VMD. בהכנה: Yasara הדגשת מוטציות, ויקי: SNPS, Wiki: Exon-Intron גבולות או אזורים עם שימור רצף גבוה ב 3D. מבחר מיידי בין אובייקטים, רצפים ומישורים · Wiki: חיפוש הפיצוץ כולל "התראה הפיצוץ" · חיזוי: ויקי: TransmeMBrane, ויקי: מבנים משניים ויקי: סליל- סליל · תרגום של רצפים נוקליאוטידים לרצפי חומצות אמינו. פלט של יישור חומצות אמינו כמו יישור נוקליאוטיד. · Protein פורמטים: Wiki: Swissprot, Wiki, MSF, Biowiki: Stockholm, Wiki: Wiki Wiki: Genbank, Embl · עצים phylogenetic עם טרקטורונים, ויקי: jalview ו genebee · הערות שאריות ונוקליאוטיד הדגשת ויקי: ביטויים רגולריים (i.e..e. prosite דפוסים) באמצעות Wiki: חיפוש מצטבר ויקי: רצף תכונות מ Wiki: DAS שרתים: סיוע רצף מסובך יישורים בשל דמיון רצף נמוך על ידי: · 3D-superposition של אטומי C-Alpha באמצעות CE ו- TM- ליישר כדי להדגיש שאריות מקבילות מרחביות · Dotplot. · רצפי ביניים · יישור רצף מעורב ומבנה חלבון · ויקי: תוספים הם הרחבות רצועה מפתחים של צד שלישי. דרישות: · ג 'אווה · מהדרים לאובייקטיבי- C ו- Fortran

רצועה תוכנה קשורה