 | פאלמהMRNA ליישור הגנום באמצעות אלגוריתמים שולי גדולים |
| הורד עכשיו | |
פאלמה דירוג וסיכום
פרסומת
- רישיון:
- GPL
- מחיר:
- FREE
- שם המפרסם:
- Friedrich Miescher Laboratory
- אתר האינטרנט של המוציא לאור:
- http://www.fml.tuebingen.mpg.de/fml
- מערכות הפעלה:
- Mac OS X
- גודל הקובץ:
- 4.4 MB
פאלמה תגים
פאלמה תיאור
MRNA ליישור הגנום באמצעות אלגוריתמים שוליים גדולים פלמה מיישרת שני רצפים גנומיים בדרך אופטימלית על פי האלגוריתם הבסיסי שלה ופרמטרים מאומנים. סקריפט Python הראשי לוקח שני קבצי fasta המכילים את היעד (למשל. רצף דנ"א, חלק הגנום) ושערות שאילתה (למשל. CDNA או רצף EST). פלמה יוצרת יישור באמצעות תכנות דינמי (כתוב ב- C + +), ומחזירה את היישור בפורמט PSL כמו. האלגוריתמים יהיו אלה שיחשבו יישורים מקומיים אופטימליים, לכן אם לא נמצאה יישור, כי לא יישור קיבל ציון יישור גבוה מספיק. דרישות: · שוגון · פייתון
פאלמה תוכנה קשורה
