פּוּמָה כלי ניתוח Bayesian של הלימות מודל מחיצות
הורד עכשיו

פּוּמָה דירוג וסיכום

פּוּמָה תגים

לְנַתֵחַ אָנָלִיזָה ביאסיאן ניתוח Bayesian.

פּוּמָה תיאור

PUMA הוא יישום מבוסס Java להעריך את הלימות של מודלים phylogenetic של אבולוציה רצף בהקשר bayesian באמצעות סימולציה חזוי אחורי. הדיוק של מסקנות phylogenetic bayesian באמצעות נתונים מולקולריים הוכח כדי לסמוך על שימוש במודלים נאותים של אבולוציה רצף. בעת בחירת המודל הטוב ביותר הזמינים מאגר של חלופות הפך לתרגול סטנדרטי בפילוגנטיקה סטטיסטית, הערכה של הלימות של המודל הנבחר הוא נדיר. תוכניות עבור מסקנות phylogenetic bayesian החלו לאחרונה ליישם מודלים של אבולוציה רצף המהווה הטרוגניות בתהליך באתרים, אך לא קיימת תוכנית כדי להעריך את הלימות של מודלים אלה. PUMA מיישמת גישה סימולציה מנבא אחורית להערכת הלימות של מחיצות, לא ברורות, ומודלים תערובת של אבולוציה רצף דנ"א בהקשר bayesian. הערכת הלימות המודל מאפשרת לפילוגניטיסטים אמפירי יש אמון מתאים בתוצאותיהם ומנחה את מאמציהם של פילוגנטואליסטים תיאורטיים בשיפור מודלים של אבולוציה רצף.

פּוּמָה תוכנה קשורה