 | סְגַלגַלבונה יישומי מרובים גלובליים של רצפי הגנום מסודרים |
| הורד עכשיו | |
סְגַלגַל דירוג וסיכום
פרסומת
- רישיון:
- GPL
- מחיר:
- FREE
- שם המפרסם:
- Aaron Darling
- אתר האינטרנט של המוציא לאור:
- http://genome-alignment.org/mauve/
- מערכות הפעלה:
- Mac OS X 10.3 or later
- גודל הקובץ:
- 14.2 MB
סְגַלגַל תגים
סְגַלגַל תיאור
בונה יישור מרובים גלובליים של רצפי הגנום מסודרים Mauve היא מערכת לבנות יעילה יישור גנום מרובות בנוכחות אירועים אבולוציוניים גדולים כגון סידור מחדש והייפוך. יישור גנום מרובות מספק בסיס למחקר בגנומיקה השוואתית ולמחקר של הדינמיקה האבולוציונית בקנה מידה חדש. יישור הגנומס שלם הוא בעיה שונה ביסודה מאשר יישור sequences.mauve קצר פותח עם הרעיון כי מרובת גנום aligner צריך לדרוש רק משאבים חישוביים צנועים. Mauve מעסיקה טכניקות אלגוריתמיות כי קנה מידה היטב בכמות רצף להיות מיושר. לדוגמה, זוג של Y. Pestis גנום ניתן ליווי תחת רגע, בעוד קבוצה של 9 גנומים entrobacterial שונים ניתן ליוותר בעוד כמה שעות. מה חדש במהדורה זו: תכונות חדשות: · תאימות עם גרסאות ישנות יותר של Mac OS X באגים קבועים: · פלט SNP עכשיו מטפל קובצי רצף מעורב ותווים פערים · השימוש בזיכרון aligner כבר יעיל, וכתוצאה מכך דרישות זיכרון מופחתות עבור יישור עם ג 'ונדים רבים · תיקון עבור באג שמנעו מחדש את גנומס טיוטת ג 'ונס בפורמט בפורמט על שורת הפקודה · קבוע לקרוס בעת יצירת אמהות · דווח על שגיאה כאשר רצפים המכילים פערים משמשים כקלט · הסרת החדשות הנוספות בתוצר היישור האורתול · קבוע OpenJDK מלבן ציור באג
סְגַלגַל תוכנה קשורה
