מערכת פונקציה איטית בקלות לדמיין גנומים גדולים
הורד עכשיו

מערכת פונקציה איטית דירוג וסיכום

מערכת פונקציה איטית תגים

נוף מכשיר חזותי גנום הצג את הגנום צופה הגנום ממחיש גנום

מערכת פונקציה איטית תיאור

בקלות לדמיין גנומס גדול מערכת פונקציה איטית היא כלי חינם וקל לשימוש להדמיה של גנומס גדול על ידי כאוס משחק ייצוג CGR (ג'פרי 1990). CGR הופך רצף DNA לתמונה צבעונית (איור מימין). כל פיקסל מתאים רצף קצר של סמלים n נקרא N-Mer. צבע של פיקסל משקף תדירות N-Mer ב annyzed sequence.The הפרמטר העיקרי של ויזואליזציה, כלומר באזור הגנום המועסקים ב ויזואליזציה נשלטת על ידי המחוון בחלק העליון של החלון. המשתמש יכול לציין אזור ישירות על ידי הזנת מיקום התחל ואורך, או באמצעות שליטה המחוון כדי להעביר את האזור במהירות דרך הגנום. מיקום בפועל ואורך האזור מוצג בשליטה המחוון כמו בר אדום עם פורמט גודל מקביל עשוי לכלול מפרט של תכונות גנומיות כגון גנים, MRNA, וכו 'אלה מוצגים קובץ קלט ורשימה בתכונות חלק של חלון. לאחר שהמשתמש בוחר תכונה התיאור שלו מוצג בחלק הנכון. לחצן Visualize ניתן להשתמש כדי לדמיין את התכונה שנבחרה באופן מיידי. זה מאפשר לנו לנתח בקלות חלקים חשובים של הגנום פשוט על ידי פרמטרים קליקים בודדים של ויזואליזציה מופיעים בסעיף הגדרות הדמיה. טווח צבעים, I.E. טרנספורמציה של תדר אוליגומר יכול להיות מותאם. ערך מינימלי מוצג בכחול ומקסימלי בצבע אדום. כאשר התאמה אוטומטית של טווח צבע נבחרה, ערך מקסימלי תמיד מחושב מחדש כדי להציג את האוליגומר הנפוץ ביותר בצבע אדום. הדגשת אוליגומרים עם תדירות נמוכה ותחתית בו זמנית ניתן להשיג על ידי סולם LogarithMic של HeatMap צבע, I.E. יומן (ספירה) מוחל על ערך נגד.

מערכת פונקציה איטית תוכנה קשורה