ILAP

ניהול נתונים מעבדה, ניתוח ופיתוח פרוטוקול
הורד עכשיו

ILAP דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • AGPL
  • מחיר:
  • FREE
  • שם המפרסם:
  • The iLAP Team
  • אתר האינטרנט של המוציא לאור:
  • http://genome.tugraz.at/

ILAP תגים


ILAP תיאור

ניהול נתונים מעבדה, ניתוח ופיתוח פרוטוקול הן מיקרוסקופיה כמותית ותפוקה גבוהה מתמודדת עם המדענים עם האתגר המרתיע של אחסון נתונים הטרוגניים בצורה מובנית ומאורגנת. בין פתרונות ניהול נתונים זמינים אין מערכת שמיש אינטואיטיבית אשר מכסה את זרימת העבודה המלאה של ניסויים מיקרוסקופיה. לכן פיתחנו את יישום האינטרנט ILAP (ניהול נתונים מעבדה, ניתוח ופיתוח פרוטוקול) המשלבת פיתוח פרוטוקול ניסיוני, רכישת נתונים מבוססי אשף ניתוח נתונים בתפוקה גבוהה לתוך מערכת אחת, משולבת. תכונה ייחודית של תוכנת ILAP היא כי הוא תומך בשלב התכנון הניסויי. פרוטוקולי העבודה שמדענים מתפתחים לניסויים מעבדה רטובים יכולים להיות מאוחסנים ומשתנים בתוך ILAP. בסופו של דבר, פרוטוקולים אלה מובילים לרכישת נתוני תמונה. ILAP ולאחר מכן מספק אשף רכישת נתונים כדי לסייע למדען בקשר את נתוני התמונה שנרכשו עם שלבים בפרוטוקול. יוזמות סטנדרטיזציה, כגון Misfishie עבור פלואורסצנטי DNA בכלאה באתרו, ניתן לתמוך על ידי אכיפת קלט של פרמטרים נדרשים במהלך רכישת נתונים זו. עיבוד נוסף וניתוח של נתוני התמונה גלם ניתן לבצע או עם מודולים ניתוח שפותחו במיוחד בתוך ILAP או עם תוכניות צד שלישי חיצוני. תצפיות חזותיות מעניינות ניתן לתעדת הערות בכל מקום.אנו הבינו ILAP כקבלת שלושה שכבת עסקים רגילה באמצעות המדינה- of-the-art jee (פלטפורמת Java, Enterprise Edition 5) טכנולוגיות תוכנה. בשל ארכיטקטורת תוכנה גמישה זו הצלחנו לפתח ממשק אינטרנט אינטואיטיבי, כמו גם סבון כללי (פשוט אובייקט גישה פרוטוקול) - מבוסס ממשק תכנות. ממשק תכנות עצמאי זה מאפשר יישומי עיבוד תמונה חיצוני כמו ImageJ כדי לגשת לקבצים המאוחסנים ב- ILAP. משימות אינטנסיביות חישוביות כמו deconvolution תלת מימדי של ערימות תמונה מופצים בשקיפות על תשתית מחשוב ביצועים גבוהים, והתוצאות מאוחסנות במערכת ניהול מסדי הנתונים היחסית הבסיסית. תוצאות אלו משויכות באופן אוטומטי עם נתוני הניסוי המקוריים. כדי להקל על קלות השימוש, המורכבות הזו של ניהול נתונים ותשתית IT מוסתרת לחלוטין מהמשתמש. IIAP הוא פרויקט קוד פתוח אשר זמין באופן חופשי עבור הקהילה מיקרוסקופיה. זה נבדק בהרחבה במתקן המיקרוסקופית שלנו במיקרוסקופיה ומשוב משתמש רציף הוביל לשיפורים בפונקציונליות, בשימושיות ובהיענות. סגולה ייחודית של ILAP היא כי הוא מוביל באופן מטבעם להקלטת בניסויים, שימור את ההקשר הניסיוני המלא של רשומות נתונים לאורך ההיסטוריה של פרויקט המחקר. דרישות: · Java 2 Standard Edition Runtime סביבה מה חדש במהדורה זו: · משופרת שמישות ובדיקה · תצוגה מקדימה של מטריקס עבור כל הקבצים המצורפים לניסויים, פרויקטים וניתוח שלבים · BigPreview עבור קבצים בחלון חלון קופץ · השוואה של פרוטוקולים · באג קריטי קבוע ב - USARMANATEN


ILAP תוכנה קשורה