Alignaid. alignaid הוא מודול perl כי בקלות להפעיל את יישומי רצף מקומית או על אשכול.
הורד עכשיו

Alignaid. דירוג וסיכום

Alignaid. תגים

פרל מודול סדר פעולות רצף יישור יישור אשכול AlignAid יישור

Alignaid. תיאור

Alignaid הוא מודול perl כי בקלות להפעיל את יישומי רצף מקומית או על אשכול. Alignaid הוא מודול perl כי בקלות להפעיל את יישומי רצף מקומית או על אשכול. # יצירת אובייקט alignaid # יחיד, פועל מקומי הפיצוץ הוא ברירת המחדל שלי $ עבודה = alignaid-> חדש (db => 'my_blast_db', dir => $ dir, fasta => 'my_query.fa', prog_args => 'V = 20 -Nnegok'); # הפעל את העבודה על המארח הנוכחי שלי retrong_value = $ עבודה-> שלח (Outfile => 'my_results.out'); # יצירת אובייקט Cross_match # ציין את תוכנית היישור ואת התור כדי לעקוף את ברירות המחדל שלי $ 2 = alignaid-> חדש (תוכנית => 'cross_match', db => 'my_db.fa', dir => $ dir, fasta => 'my_Query_seqs.fa', תור => 'LSF'); # שלח את עבודות Cross_match לתור LSF (של צמתים לחשב) $ retrong_value2 = $ Job2-> שלח (Outfile => 'my_output'); # להרוג את עבודות oodued שלי $ retrong_value3 = $ job2-> kill_all; alignaid נועד להקל על תוכניות היישור רצף הפיצוץ cross_match. Alignaid יכול לקבל מספר רב של רצפים שאילתה. אם תור אשכול חישוב כגון LSF או PBS זמין, alignaid יכול לפצל באופן אוטומטי את השאילתות לתוך תור תור מספר. כמו כן, אם אתה רוצה להפעיל את יישור מקומי על מארח יחיד, שינוי אחד הוא כל מה שצריך - Alignaid יטפל כיצד להפעיל את תוכניות היישור ולנהל את הפלט .Alignaid יש גם תמיכה ראשונית עבור LSF תור בקרת עבודה; ניתן להרוג משרות באמצעות ממשק של Alignaid.What חדש במהדורה זו: · perl

Alignaid. תוכנה קשורה