הָמוֹן

מוצא מוטיב יעיל מדויק עבור ערכות נתונים גדולות
הורד עכשיו

הָמוֹן דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • BSD License
  • מחיר:
  • FREE
  • שם המפרסם:
  • John Reid
  • אתר האינטרנט של המוציא לאור:
  • http://sysbio.mrc-bsu.cam.ac.uk/

הָמוֹן תגים


הָמוֹן תיאור

פרויקט השטווה התחיל את החיים כקירוב אל אלגוריתם המצפה למקסימליזציה לסוג המודל המשמש במוצרי מוטיב, כגון קירוב EM.STEME של Meme.Steme מפעיל סדר גודל מהר יותר מאשר יישום Meme עבור הגדרות פרמטרים טיפוסי. St עמדה פיתחה עכשיו לתוך מוצא מוטיב מלא במלואו במפל עצמו.השימוש בשמחה? הוכחה Motif מציאת טכניקות הוא מבוסס על אלגוריתם meme-steel. Meme הוא אחד המוטיב הבוגר ביותר ופופולרי מוטיב. זה היה אחד הפורצנים העליונים של השוואה של Tompa et al. של השוואה של מוטיב מוציאים Steme נבדק על קלט בעשרות מגהאבות, אבל אין שום סיבה מדוע זה לא צריך לשמש על נתונים גדולים יותר. בדרך כלל מוצרי מוטיב יש זמן ריצה שגדל במהירות עם גודל הקלט. בשל השימוש של steme של סיומת עצים זה לא סובל בעיה זו. SteMe מספק אפשרויות לשלוט על זמן ריצה, כך שהמשתמש שולט כמה זמן הם מוכנים לחכות לתוצאות.פעלי Motif Motif Motivers Motif (במיוחד מוצא מוצני מוטיב מהיר) השתמש רצפים קונצנזוס כמו מודלים של אתרים מחייב. אלה אינם גמישים כמו PWMs כי השכלה השכלה ולא יכול ללכוד את אותו טווח של מוטיבים כמו pwms.easy כדי iTestreme מייצרת פלט בפורמט הוקמה היטב מייצר את כלים במורד הזרם. פלט של Steme נבדק עם כלים מ eme, byopython ו bioperl.Accurate משמעות משמעותי חישובים משמעותיים מתוכננים עם נתונים גדולים קובע בראש. מוצרי מוטיב שלא נכתבו עבור ערכות נתונים גדולות יכול לעתים קרובות לטעות באופן רע את המשמעות של מוטיבים שהם מוצאים. זוהי בעיה מתחתנת במיוחד וקשה עבור המשתמש כדי לזהות.אווירית כמו שרת אינטרנט יכול להיות מותקן מקומית על המחשב שלך או יכול להיות לרוץ דרך האינטרנט שלנו servers.package תיעוד דף הבית של דף הבית


הָמוֹן תוכנה קשורה

Burrows-Wheeler Aligner

תוכנית יעילה אשר מיישר רצפים נוקליאוטידים קצרים יחסית נגד רצף התייחסות ארוכה ... ...

83

הורד