ביו :: עץ :: מרחק ביו :: עץ :: מרחק הוא מודול פרל לבנות עץ באמצעות שיטות מבוססות מרחק.
הורד עכשיו

ביו :: עץ :: מרחק דירוג וסיכום

ביו :: עץ :: מרחק תגים

פרל מודול עֵץ לִבנוֹת עץ מבנה מרחק עץ

ביו :: עץ :: מרחק תיאור

ביו :: Tree :: DistanceFactory הוא מודול פרל לבנות עץ בשיטות מבוססות המרחק. ביו :: Tree :: DistanceFactory הוא מודול פרל לבנות עץ בעזרת מבוסס המרחק methods.SYNOPSIS השימוש ביו :: Tree :: DistanceFactory; להשתמש ביו :: AlignIO; ביו שימוש :: יישר :: DNAStatistics; tfactory $ שלי = ביו :: Tree :: DistanceFactory-> חדשות (-method => "NJ"); סטטיסטיקת $ שלי = ביו :: יישר :: DNAStatistics-> חדשות (); $ שלי alnin = ביו :: AlignIO-> חדשות (-format => 'ClustalW', -file => 'file.aln'); שלי $ AlN = $ alnin-> next_aln; # של מטריקס כמובן יכול לבוא מתוך # במקום אחר כמו PHYLIP אם אתם מעדיפים, ביו :: מטריקס :: IO צריך להיות # מצליחים לנתח דברים רבים שלי $ jcmatrix = $ stats-> המרחק (-align => $ AlN, - שיטה => 'Jukes-חזן'); עץ $ שלי = $ tfactory-> make_tree (jcmatrix $); זהו מפעל אשר יבנה עץ פילוגנטי מבוסס על מרחקי רצף pairwise עבור קבוצה של רצפים. נכון לעכשיו UPGMA (סוקל ו מיצ'נר 1958) ו NJ (Saitou ו ניי 1987) שיטות בניית עץ מיושמות. דרישות: · פרל

ביו :: עץ :: מרחק תוכנה קשורה