paxtools. דירוג וסיכום
paxtools. תגים
paxtools. תיאור
PaxTools הוא יישום המשמש את פורמט חילופי נתונים עבור מידע ביולוגי מסלול. Biopax היא שפה סטנדרטית שמטרתה לאפשר אינטגרציה, חילופי, להדמיה וניתוח נתוני מסלול ביולוגי. באופן ספציפי, Biopax תומך חילופי נתונים בין קבוצות נתיבי מסלול ובכך מפחית את המורכבות של מחלף בין פורמטים של נתונים על ידי מתן תבנית סטנדרטית מקובלת לנתוני מסלול. על ידי מתן סטנדרטי, עם סמנטיקה מוגדרת היטב לייצוג נתיב, Biopax מאפשר מסדי נתונים של מסגת ותוכנה לקיים אינטראקציה ביעילות רבה יותר. בנוסף, BIOPAX מאפשרת פיתוח של ויזואליזציה של מסדרת מסדי נתונים ומאפשר ניתוח של נתונים שנוצרו בניסוי באמצעות שילוב עם ידע מוקדם. מאמץ Biopax מתואם מקרוב עם יוזמות סטנדרטים אחרים של נתיב אחר; PSI-MI, SBML, Cellml ו- SBGN כדי לספק תקן תואם באזורים שבהם הם חופפים.
paxtools. תוכנה קשורה