Uea קטן rna workbench סוויטה של כלים לנתח נתוני RNA קטנים מהדיור הבא
הורד עכשיו

Uea קטן rna workbench דירוג וסיכום

Uea קטן rna workbench תגים

Uea קטן rna workbench תיאור

Uea קטן RNA Workbench הוא יישום שפותחה כדי לעזור ביולוגים לנתח יחיד או מרובים מדגם נתונים SRNA מן הצמחים ובעלי חיים. ניתן להשתמש ביישום זה כדי לזהות ציוני דרך מעניינים (כגון איתור של רצפים מיקרו רנ"א) או משימות אחרות כגון דפוסי ביטוי RNA קטנים בנתונים גנטיים. תכונות עיקריות: מתאם Remover: מסיר שברי מתאם מ RAW קצר לקרוא רצף נתונים נתונים נתונים לפורמט FASTA. מסנן: מייצרת גרסה מסוננת של מערך SRNA, הנשלטת על ידי מספר קריטריונים מוגדרים על ידי המשתמש, כולל אורך רצף, שפע, המורכבות, ההעברה והריבוסומלית הסרת RNA. מירקאת (מירנה סיווג): צופה בוגרת Mirnas ואת מבשריהם מתוך מערך SRNA וגנום. Siloco (קצר מפריע RNA Locus השוואה): משווה רמות ביטוי SRNA ב דגימות מרובות על ידי קיבוץ srnas לתוך loci מבוסס על מיקום גנומי. TA-SIRNA (TRANS- משחק קצר מפריע RNA): חיזוי של ta-sirnas בשלבים במערכי נתונים SRNA הצמח. Mirprof (Mirna Profiler): קובע רמות ביטוי מנורמל של SRNAS התאמת Mirnas ב Mirbase. ביאור hairpin: מייצר מבנה משני מתוך רצף RNA ו מדגיש אזורים של עניין באמצעות Rnaplot. VISSR (ויזואליזציה של SRNAS): ליצור ייצוג חזותי של תכונות גנומיות של SRNAS ו מיובאים למשתמש. Paresnip: לזהות מטרות מירנה הראה דרך degradome

Uea קטן rna workbench תוכנה קשורה