Stepp: טכניקה SVM להעריך פפטידים porteotypic יישום להעריך פפטידים porteotypic
הורד עכשיו

Stepp: טכניקה SVM להעריך פפטידים porteotypic דירוג וסיכום

Stepp: טכניקה SVM להעריך פפטידים porteotypic תגים

להעריך הַעֲרָכָה עיון בפפטידים פפטיד לכמת פפטידים שכותרתו ICPL פפטידים לכמת MALDI לכמת פפטידים פפטידה פרוטיאטיפית טכניקת SVM. הערכה פפטיד הערכת codon שימוש הערכת

Stepp: טכניקה SVM להעריך פפטידים porteotypic תיאור

Stepp הוא כלי מתקדם שנועד לחשב ציון המייצג איך "porteotypic" פפטיד הוא על ידי LC-MS. התוכנית יכולה לקרוא קובץ חלבון, לבצע עיכול סיליקון, ולחשוב את ציון היציבות עבור כל פפטיד טריסטי או טריפטי חלקית. שים לב כי ציונים גדול יותר (חיובי) אומר פפטיד הוא חזה להיות יותר porteotypic בעוד נמוך (שלילי) ציונים אומר פפטיד לא ניבא להיות porteotypic. מודל SVM בשימוש על ידי Stepp הוא שטח מתאר פשוט מבוסס על 35 תכונות של תוכן חומצת אמינו, תשלום, הידרופיליות, וטפיטיות עבור חיזוי כמותי של פפטידים porteotypic. המודל הוכשר ואושר עם שלושה מסדי נתונים של AMT נוגעים באופן עצמאי (Sheewanella Oneidensis, Salmonella Typhimurium, Pestis Yersinia). SVM הביא למדוד דיוק ממוצע של 0.8 עם סטיית תקן של פחות מ 0.025.

Stepp: טכניקה SVM להעריך פפטידים porteotypic תוכנה קשורה