Seq-gen

מדמה את האבולוציה של נוקליאוטיד או חומצות אמינו רצפים
הורד עכשיו

Seq-gen דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • Freeware
  • שם המפרסם:
  • Andrew Rambaut
  • מערכות הפעלה:
  • Windows All
  • גודל הקובץ:
  • 281 KB

Seq-gen תגים


Seq-gen תיאור

SEQ-GEN פותחה להיות תוכנית אשר יהיה לדמות את האבולוציה של נוקליאוטיד או חומצת אמינו רצפים לאורך phylogeny, באמצעות מודלים נפוצים של תהליך החלפה. מגוון מודלים של אבולוציה מולקולרית מיושמים, כולל המודל הכללי הפיך. תדרי המדינה ופרמטרים אחרים של המודל עשויים להינתן הטרוגניות קצב ספציפיות באתר עשוי להיות משולב גם במספר דרכים. כל מספר של עצים ניתן לקרוא את התוכנית תייצר כל מספר של נתונים ערכות עבור כל עץ. כך ניתן ליצור קובע גדול של סימולציות לשכפל בקלות. זה תוכנן להיות סימולטור כללי מטרה המשלבת את רוב המודלים הנפוצים (וחישובית) של אבולוציה רצף מולקולרית. SEQ-GEN הוא תוכנית שורת הפקודה שנכתבה ANSI C. זה צריך להיות בקלות להרכיב ולהפעיל על כל מערכת UNIX או תחנת עבודה. מאמר זה מתאר את השימוש ב- Seq-Gen על מכונת יוניקס. היישום דורש כמות של זיכרון פרופורציונלי לגודל של כל נתוני רצף סימולציה להגדיר. הפעלת SEQ-Gen כדי להפעיל את SEQ-Gen אתה סוג: SEQ-GEN <> איפה הם הפרמטרים עבור התוכנית (המתואר להלן), הוא קובץ העץ ו הוא שם הקובץ שיכיל את הרצפים המדומים. קובץ העץ חייב להכיל עצים אחד או יותר בפורמט Phylip. רצפים המיוצרים על ידי SEQ-Gen נכתבים לתפוקה הסטנדרטית (ולכן ניתן להפנות את קובץ הפלט באמצעות> ). מידע ותוצאות אחרות נכתבים לשגיאה הסטנדרטית ולכן יופיעו על המסך.


Seq-gen תוכנה קשורה

Quagi

עיצוב quagi אנטנות עם יישום זה ...

428 48 KB

הורד

POPGENE.S2

popgene.s2 היא תוכנית חופשית המאפשרת לך ללמוד גנטיקה האוכלוסייה. ...

1,071 5.6 MB

הורד