| Prottest בחירה של מודלים בהתאמה הטובה ביותר של אבולוציה חלבון. |
הורד עכשיו |
Prottest דירוג וסיכום
- שם המפרסם:
- The University of Vigo
- מערכות הפעלה:
- Windows All
Prottest תגים
Prottest תיאור
Prottest (קרוב משפחה של מודל) היא תוכנית לבחירת המודל של אבולוציה חלבון המתאים ביותר קבוצה מסוימת של רצפים (יישור). מודלים כלולים הם מטריצות תחליף אמפיריים (כגון WAG, LG, MTREV, Dayhoff, Dcmut, JTT, VT, Blosum62, CPREV, RTREV, MTMAM, MTART, HIVB ו- HIVW) המצביעים על שיעור יחסי של החלפת חומצות אמינו, ושיפורים ספציפיים (+ I: אתרים בלתי הולמים, + G: הטרוגניות קצב בקרב אתרים, + F: תדרי חומצות אמינו) כדי להסביר את האילוצים האבולוציוניים אינה מרוצה על ידי שימור של מבנה חלבון ותפקוד. Prottest משתמשת בקריטריון מידע Akaike (AIC) וסטטיסטיקה אחרים (AICC ו- BIC) כדי למצוא איזה מודלים המועמד הכי טוב מתאים לנתונים בהישג יד. תן prottest לנסות להעריך באופן מלא את היכולות שלה!
Prottest תוכנה קשורה