Predy קוד פתוח Python החבילה עבור חלבון מבנית ניתוח דינמיקה
הורד עכשיו

Predy דירוג וסיכום

Predy תגים

אָנָלִיזָה חֶלְבּוֹן דִינָמִיקָה ניתוח חלבון ניתוח חלבון

Predy תיאור

קוד פתוח Python החבילה לניתוח דינמיקה מבנית חלבון Prody הוא בחינם, קוד פתוח python החבילה לניתוח דינמיקה מבנית חלבון. זה מאפשר ניתוח כמותי של מערכי נתונים ניסיוניים ההטרוגניים והשוואה עם דינמיקה קונפורמטיבית תיאורטית. הוא מתוכנן ופיתח על ידי אחמט באקאן במעבדה באהר באוניברסיטת פיטסבורג. הקלט עבור prody הוא הקואורדינטות האטומיות של חלבון השאילתה בפורמט קובץ PDB, או פשוט מזהה PDB או מכתב אחד חומצת אמינו רצף של החלבון. מינים פרודיים מהירים וגמישים משמשים לאחזרת הנתונים המתאימים של קבצי PDB משרת ה- FTP של PDB ו לחלץ את הנתונים הקואורדינטות שלהם ומידע רלוונטי אחר. Prody תפוקות הדפוסים הדומיננטיים בשונות מבניים שחולצו על ידי ניתוח רכיבים עיקריים (PCA) של מערכי הניסוי, והמצבים הרגילים המתארים את הדינמיקה הפנימית של חלבונים ניבא על ידי ניתוח מצב רגיל (NMA).

Predy תוכנה קשורה