Phire חיפוש על רצפי הגנום של Bacteriophage עבור בלוקים המציגים דמיון רצף.
הורד עכשיו

Phire דירוג וסיכום

Phire תגים

מחפש דמיון צבע דִמיוֹן דמיון משתנה בולט דפדפן הגנום ציין הגנום לדמיין את הגנום גנום דמיון נוף רצף התמונה המוצגת חיפוש רצף הגנום המחפש רצף הגנום למצוא הגנום רצף בקטריופאג לנתח את הגנום ניתוח הגנום הצגת מספר גנום חיפוש הגנום הצג רצף הגנום צופה רצף הגנום הצג רצף הגנום הצג את נתוני הגנום עיין בגנום הצג את הגנום גנום שפה אלגוריתם דמיון טקסט הגנום של פרוקריוטי Arabidopsis ניתוח הגנום צפה בנג'ידופסיס הגנום לנתח את הגנום של ערבידופסיס לנתח את הגנום החיידקי הגנום ויזואליזציה צופה הגנום גנום רחב מיין דמיון רצף דמיון להשוות הגנום רצף השוואה רצף הגנום רצף הגנום מסלול דפדפן גנום UCSC הצג את קובץ הגנום הצגת נתוני הגנום ברצף הגנום החיידקי גנום סייר הגנום מיקרוביאלי מאפיין את הגנום אפיון הגנום צפה בגנום חיידקי דמיון תמונה אחוז דמיון דמיון חזותי

Phire תיאור

תוכנית Phire, תוכנית עצמאית ב Visual Basic, מבצעת חיפוש מבוסס מחרוזת אלגוריתמית על רצפי הגנום של Bacteriophage, לגלות וחילוץ בלוקים המציגים דממות רצף, המתאים אלמנטים רגולטוריים משומרים הכלולים בתוך גנוומים אלה באופן שיטתי, ללא כל ניסוי קודם או ידע חזוי. Phire משווה באופן שיטתי את כל תתיכנות ה- DNA של אורך מסוים (L) זה לזה, ומאפשר מספר מצומצם של אי-התאמה (ניוון ד) כדי למיין ולחלץ את הקבוצות הגדולות ביותר (דומיננטום) של תעלולים המייצגים קונצנזוס ייחודי. בדרך זו, הגנום כולו יהיה מנותח על ווטסון ו CRICK DNA גדיל גם כן. על מנת לדמיין את הרצפים סביב רצף הקונצנזוס, גודל החלון (W) יכול להיות מותאם כדי לכלול את רצפים שמאלה וימין של כל מחרוזת DNA נבחרת.

Phire תוכנה קשורה