Peakfinder מאתרת פסגות (אתרי מחייב Cohamin) בנתונים שבב שמרים צ'יפ
הורד עכשיו

Peakfinder דירוג וסיכום

Peakfinder תגים

מוֹצֵא מאתר פרוטוקול אלתר מחייב הצג מחייב פרוטוקול מחייב פרוטוקול שִׂיא בחר כריכה מחייב סקי. ליישם מחייב רנדמן מחייב מנגנון מחייב גמיש מיזוג נתונים כריכה C + + לואוה מחייב צור מחייב יצירת מחייב ספריית מחייב QT 4 מחייב .NET מחייב מחייב להגדיר טווין פסגות שומר מסך פסגות תאומות מחייב API API מחייב QT. כריכת פיתון אתר שיא למצוא שיא Locator שיא הצג פסגות כרומטוגרפיות ניתוח פסגות כרומטוגרפי מסד נתונים API מחייב פסגות Tri ג 'וי. יוצר פסיפס טקסט חומצה ירידה 1.0. N73 Ringtone Cutter. הורד טור דפדפן הסר בבטחה usb Adobe Acrobat5 סדרתי nero plugin lame. כותב php NRG קובץ Extractor. sims3pack חנות הגוף נהג Ethernet האוניברסלי מנהל התקן Bluetooth IV

Peakfinder תיאור

יישום PeakFinder פותחה כדי להיות כלי מאתרת פסגות (אתרי מחייב Cohamin) ב שבב שמרים (chromatin immunoprecipitation) נתונים microarry. PeakFinder הוא כלי הדמיה הגנום המחפש נתוני יחס microarray עבור "פסגות". הפסגות נמצאות באמצעות עקומה מוחלקת שניתן לבחור באופן אינטראקטיבי. תוכן נוקליאוטיד באמצעות חלון נעים שצוין ניתן להציג יחד עם תוצאות microarray. התוכנית היא כמעט גנרית עבור כל גנום, אבל עדיין יש כמה פרמטרים רק שמרים בלבד. קבצי קלט: - קובץ Genomeindex.dat: קואורדינטות לספר את המיקום של כל כרומוזום בתוך הגנום. מיקום Centromere צוין גם. - "תכונה קואורדינטות" גליון עבודה של Excel: עמודות A, B ו- C חייב להיות שם, COQUAND1, COQUAND 2. הקואורדינטות הן קואורדינטות הגנום עבור כל תכונה. - "יחסים" Excel גליון עבודה עם Microarray נתונים: עמודה חייב להיות "iname". נתוני היחס נמנעים בטור האחרון. ערכי התכונה "InAME" חייבים להאין את אלה שצוינו בתכונת המתאם גליון. - ספרייה עם רצפים נוקליאוטידים, קובץ אחד עבור כל כרומוזום. נתוני רצף יכול להיות בפורמט Fasta עם Defline, או פשוט קובץ ASCII. שמות הקבצים חייבים להיות Chr * או Chrnn *. לדוגמה, Chr05.FSA, או Chrviii_562639.ascii. או "הישן" או "חדש" פורמט קובץ מסד נתונים גנום מקובל. - Peakfinder.ini נמצאת בספרייה C: \ מסמכים והגדרות \ הגדרות מקומיות \ נתוני יישום \ StowersInstitute \ Peakfinder קבצי פלט: - התרשים ממוקם באופן אוטומטי על הלוח, אם האפשרות SitMAP או Metafile נבחרה, והוא יכול להיות מודבק מיד לתוך כל יישום אחר לאחר מוצג. (ביטול הסימון תיבת שמירה אוטומטית מפסיק את המיקום האוטומטי של התרשים על הלוח). אחרת, לחץ על הלחצן שמור בטבש התרשים כדי לשמור את התרשים לקובץ GIF שצוין. - ניתן לבחור את לחצן Peaks SaveS בפסיקים כדי לשמור קובץ Peaks.csv, אשר ניתן לפתוח ב- Excel. - הלחצן "תהליך הכל" על התוצאות של Rawdata Tabsheet בתביעה של קבצים המיוצרים. בדרך כלל ציין ספרייה חדשה וזה יכיל קבצים אלה כאשר העיבוד הוא הושלם: Ratiofilename.dat, Ratiofilename-chromosomenn.gif (nn = 01 ל 16), ratiofilename-peaks.csv, שבו ratiofilename הוא שם של יחס Excel הקובץ שצוין על נתונים גולמיים.

Peakfinder תוכנה קשורה