Metasim

יצירת סינתטי קורא אוספים עם יישום זה.
הורד עכשיו

Metasim דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • Freeware
  • שם המפרסם:
  • Daniel H. Huson
  • גודל הקובץ:
  • 14.7 MB

Metasim תגים


Metasim תיאור

מטאזים הוא כלי שימושי שתוכנן במיוחד כדי לעזור לך ליצור אוספים של קורא סינתטי המשקף את הרכב הטקסונומי המגוון של ערכות נתונים metagenome טיפוסי. בהתבסס על מסד נתונים של גנומים נתון, התוכנית מאפשרת למשתמש לעצב metagenome על ידי ציון מספר הגנום הנוכחי ברמות שונות של טקסונומיה NCBI, ולאחר מכן לאסוף קורא של metagenome באמצעות סימולציה של מספר רצף שונים טכנולוגיות . דגימת אוכלוסייה אופציונלית מייצרת רצפים מתפתחים המבוססים על גנומס מקור ועץ אבולוציוני נתון. ניתן להשתמש בנתונים המתקבלים תרחישים מבחנים סטנדרטיים לתכנון פרויקטים רצף או עבור אסמבלר Benchmarking ותוכנות metagenomic. תכונות עיקריות: משלבת מסד נתונים עבור רצפי הגנום המקור מייצר קבוצות של סינתטי קורא או זוג זוגות מבוסס על מודלים שגיאה ברצף הסתגלות (למשל עבור כימיה סנגר, Roche's 454 וילמינה (לשעבר Solexa) מאפשרת למשתמש להגדיר ערכי שפע עבור כל אורגניזם לדגם קומפוזיציות ספציפיות מיכון מספק דגימה אוכלוסייה לייצר רצפים מתפתחים על בסיס גנומס מקור עץ אבולוציוני נתון ניתן לשלוט באמצעות ממשק משתמש גרפי או במצב שורת הפקודה


Metasim תוכנה קשורה