GZ-Gamma הערכת המספר הצפוי של תחליפים בכל אתר חומצת אמינו
הורד עכשיו

GZ-Gamma דירוג וסיכום

GZ-Gamma תגים

סדר פעולות אוּמדָן חוּמצָה רצף DNA אמידת זמן חומצה טיטרציה דננה גופן חומצה אומדן פערים עסקת חומצה אומדן FDR. למצוא חומצות אמינו חומצת אמינו Finder. חפש חומצת אמינו Anal Analyzer חומצה רצף חומצות אמינו חומצת אמינו חומצת אמינו מתרגם לחלץ חומצות אמינו אומדן ביצועים הערכת אוסמוזה פתרון חומצה חומצות אמינו שאריות חומצת אמינו אופטימלית ניתוח חומצות אמינו חומצות גרעין ספירת תחליפים מספר לנתח זוג חומצות אמינו חומצות אמינו אומדן גדול phylogeny. חומצת אמינו ניתוח רצף ניתוח רצף חומצות אמינו סיווג חומצות אמינו חומצת אמינו טופולוגיה ניתוח Aminoacid. קשר פילוגנטי חומצת אמינו אמינו-חומצה גלאי לזהות חומצה אמינו הערכת מאמץ לנתח שרשרת חומצות אמינו לולאות חומצה צָפוּי חזרה צפויה חומצה פרו Acid Pro 7

GZ-Gamma תיאור

GZ-Gamma פותחה כדי להעריך את המספר הצפוי של אתר של חומצות אמינו (nucleotide), ופרמטר צורת גמא עבור וריאציה שיעור בקרב אתרים, תוך שימוש בשילוב של סידן רצף אבות ואומדנת סבירות מקסימלית כאשר היחסים הפילוגנטיים של אלה רצפים הומולוגיים ידועים. חבילה זו מכילה שתי תוכניות: GZ-Aa.exe עבור רצפים חומצות אמינו, ו- GZ-DNA.exe עבור רצפים DNA, אשר מקודדים בשפה C. כדי להשתמש בתוכנית, אתה צריך קובץ קלט אחד המכיל את חומצת האמינו (או nucleotide) רצפים טופולוגיה עץ של רצפים אלה (ראה ATP6.AA עבור דוגמה). קובץ זה מתחיל עם שני מספרים: מספר רצפים ומספר חומצת האמינו או אתרי נוקליאוטידים (אורך רצף). השורה השנייה תהיה שם הרצף הראשון, והקו השלישי יהיה הרצף הראשון, וכן הלאה. כל רצף צריך לכבוש שורה ללא הפרעה כלשהי. רק האותיות (מהוון) עבור 20 חומצות האמינו (או 4 נוקליאוטידים) מותרות ברצפים. הפערים או כל הסמלים האחרים היו צריכים כבר הוסרו. השורה האחרונה של הקובץ היא טופולוגיית עץ של רצפים. פורמט העץ הוא זהה לזה בשימוש בחבילת Phylip. שים לב כי העץ הוא unrroated, ולכן הפעלת ולא בתוספת נדרשת עבור הצומת העמוק ביותר

GZ-Gamma תוכנה קשורה